EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-19216 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr22:1787897-1788540 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BATF3MA0835.1chr22:1787971-1787985TGATGACGTCAGCG-6.56
BATF3MA0835.1chr22:1787971-1787985TGATGACGTCAGCG+7.03
LMX1BMA0703.2chr22:1788450-1788461AATTTAATTAA+6.32
Lhx3MA0135.1chr22:1788451-1788464ATTTAATTAATTA-6
Enhancer Sequence
CCATGTTTTC CTCCATTGAA TATTAACAAT TATGGATCGC AAAACTGATG ACCGTCGTTG 60
CGCCCCTCTC GCCGTGATGA CGTCAGCGCT GACGCGTTCA TTCAGCGTCG CTTCTTCAGA 120
GCTGAGGTGA GTCGTTGACG CTTTTTCTCG TGTTTACACA ACAATAAAAC ACACTTTACA 180
GTTTATTAAA GCGACAATCT GCGACTAGTT TCTGCATTGA GTTCACCTCT ATCTGTGTGT 240
CTGCTGACCA AAACAATACA GCAGGCAGAG AGCAGCTCTG AGAGGAAAAC TACTTGTGTG 300
AGGAAACTCC TTTTCCACGT TTGTATTATC AATATCGTGA AGAATAATCT GTGAATGGAA 360
AGAGTGGGAA TATATGGCGA CAGTAGAGGG AGAAAACATT ACATTAAGCT CTTTATTCTT 420
AAAAGGTTTT TCTGTTTTCC CAGTTTCTCT ACATAGATTT GCTACTGCTA ACAATCAAAA 480
TACTTTATTT GCTATGCGTA ACGTTACGTG GATAATATTT AAACTAAGTA TTGAGGTAAA 540
CGTGAAAATA TACAATTTAA TTAATTACAA TAGTAATTGT TTTATCCTTT AAACATAAAT 600
ACAATGATAT ATAAAAAGAG CTGATCTGCT GCTGATCCTA AAT 643