EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-19085 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr21:45655505-45656138 
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RFX1MA0509.2chr21:45655542-45655558AGTTGCTATGGTAACA-6.54
RFX1MA0509.2chr21:45655593-45655609AGTTGCTATGGTAACA-6.54
RFX1MA0509.2chr21:45655542-45655558AGTTGCTATGGTAACA+6.55
RFX1MA0509.2chr21:45655593-45655609AGTTGCTATGGTAACA+6.55
RFX2MA0600.2chr21:45655542-45655558AGTTGCTATGGTAACA+6.82
RFX2MA0600.2chr21:45655593-45655609AGTTGCTATGGTAACA+6.82
RFX2MA0600.2chr21:45655542-45655558AGTTGCTATGGTAACA-6.86
RFX2MA0600.2chr21:45655593-45655609AGTTGCTATGGTAACA-6.86
RFX3MA0798.1chr21:45655542-45655558AGTTGCTATGGTAACA+6.48
RFX3MA0798.1chr21:45655593-45655609AGTTGCTATGGTAACA+6.48
RFX3MA0798.1chr21:45655542-45655558AGTTGCTATGGTAACA-6.73
RFX3MA0798.1chr21:45655593-45655609AGTTGCTATGGTAACA-6.73
RFX4MA0799.1chr21:45655542-45655558AGTTGCTATGGTAACA+6.28
RFX4MA0799.1chr21:45655593-45655609AGTTGCTATGGTAACA+6.28
RFX4MA0799.1chr21:45655542-45655558AGTTGCTATGGTAACA-6.69
RFX4MA0799.1chr21:45655593-45655609AGTTGCTATGGTAACA-6.69
RFX5MA0510.2chr21:45655542-45655558AGTTGCTATGGTAACA+7.13
RFX5MA0510.2chr21:45655593-45655609AGTTGCTATGGTAACA+7.13
RFX5MA0510.2chr21:45655542-45655558AGTTGCTATGGTAACA-7.14
RFX5MA0510.2chr21:45655593-45655609AGTTGCTATGGTAACA-7.14
Enhancer Sequence
AGCAACTATA GTAATTAATC TGTTCTGGTG ATTCTACAGT TGCTATGGTA ACACAACTAT 60
AGTAATTAAT CTGTTGTGGT GATTCCACAG TTGCTATGGT AACACATCTA CAGTACATAT 120
CACAGTATAT TGGTTCACTA TATGTATATG TACAGTATGC TGTTGCATTC AATTACAAAG 180
AGTGGTAAAT ATAGTAAAAC ACACAGTATA ATACACTTGA CTATACTACA CTCTAACAAA 240
CACTGGGTTA TTTTAAACCT CAACACAGCA GTCGGGTTTG TACATTCTTT ACACATTTTG 300
GGCAAAGCTT GGACTTCCCT TTTACTGAAG GCCAGCAGGA TTTAAAGGAA ACTGTGCATT 360
ATGAAAAAAC AGCATTGTAG AGTGTGGTAA AACACGGTAA TATTTACTAT AAACAGATAT 420
ATATATATTT ACCATATTTA TGTATTGACT ATAAACCACG GTATTTCTGA GCGGGTGTTT 480
GAGAAGCGTA TCCTCCTCTA TCATCACTCT CCAGCAGTCT GATCAAAATA TAAAACCAGC 540
TGATGATGCA CTCGGAAAAA TGCTGCCTTG TAGAAACTGT GTGTTGGGTC AAATATACAC 600
AAGCGCAGCC GCTGGGTTAA AGAGTGTCAT CTA 633