EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-19019 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr21:44046335-44047749 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr21:44047124-44047136AAATGTTTGTTT+6.27
HNF1AMA0046.2chr21:44047722-44047737TATAAATAATTAACA+6.59
HNF1AMA0046.2chr21:44046661-44046676TGTTAATTATTTATA-6.59
HNF1BMA0153.2chr21:44046662-44046675GTTAATTATTTAT+6
HNF1BMA0153.2chr21:44047723-44047736ATAAATAATTAAC-6
Enhancer Sequence
CAGCGGTCTT GCGTCCTCGT GTTCTCGTGA AACGTCATCA TCAGCTGCCT AAGTTCAGTT 60
CCAATACTCA AGACCGCAAG TATGGAGGAC GCGTGAAACT TCCCGGATGT GTTCTTGATA 120
TCGAGGACGC ACCGATGCAG ACTTGAGCAC CGAACTTGCT CTAGAAGTCC TAGAAGTCAT 180
TGCGACTGGA GGTGGGAAGC GCAGCATTTT ATTTAGATTT ATTGGTAACA CTTTAGAATA 240
ACTATCCGTT ATAACTAGTT AATAGACCAT TAATAAACTT TTAGTTAACA AGTTATAAAT 300
GACTTGTTAA ACAAAAGTTA ATAGTTTGTT AATTATTTAT ACTTGTGCCT TATAGATGGG 360
CAATGGATAA CTTACAAGCT GTTAGTTAAC AAGTTGTAAA TTTCTTCTTA ACTGTATTTT 420
AATGATTTAT AACTATACCT AAAACATTAG TAATAGATCA TGAACAAGCT GTTAGTAAAT 480
AACTTAATAA AGGCTTGTTA AGTATCAGTT AATAGTGTAT ATATGTTATT GGGACGTTAT 540
TCTAAAGTTG CAGCTATTCT TCATTTATTA ACTGTTAGTA AATGAGGAAT AGTTGCAACT 600
TTAGAATAAC GTCCCAATAA CATGCTTGAG CTAATAACTA ACACTTAACT ATTATATTTA 660
CTCACACTTC ACAGACGAGA GTTGTTCATC GTTTGTTAAC CATCTACTAA TACCAGAGAA 720
TCTTTGTAGA ACAGCAAATG GATGGAACAA GTTCAAGCTA CAGAAATTTG ATGTAATATT 780
TAAAATATAA AATGTTTGTT TTTAAACCTT GTTCCACTTA TAGGCTATTC TGTGTGCTGT 840
GTTTTACCAA AGAAACTCCA CATATGAAAT GTTAAACGTT GTGTTTAATG TATAGAAACA 900
CACATACTGC GCCATCACAT GGCAGTACAA CAGTATGCAA GAATACAAAC CCATGAAGTG 960
CTAAACATGA AAACAAAATA AATAAAAATG TAAAATTACA CCAGTGGTCT AATAAAAAAG 1020
TTTCACTGGT GTTATTAGAT GGTGAACAAC TGATCTGTAA AGTGTGAGTA AATATAATAG 1080
TTAAGTGTTA GTTATTAGCT CAAGCATGTT ATTGGGACGT TATTCTAAAG TTGCAACTAT 1140
TCCTCATTTA CTAACAGTTA ATAAATGAAG AATAGCTGCA ACTTTAGAAT AACGTCCCAA 1200
TAACATACAT ACACTATTAA CTGATACTTA ACAAGTCTTT ATTAAGTTAT TTACTAACAG 1260
CTTGTTCATG ATCTATTACT AATGTTTTAG GTATAGTTAT AAATCCTTAA AATACAGTTA 1320
AGAAGAAATT TACAACTTGT TAACTAACAG CTTGTAAGTT ATCTATTAGC CATCTATAAG 1380
GCACAAGTAT AAATAATTAA CAAACTATTA ACTT 1414