EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-18990 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr21:43025952-43027272 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PHOX2AMA0713.1chr21:43027077-43027088TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr21:43027077-43027088TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr21:43027077-43027088TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr21:43027077-43027088TAATTAAATTA-6.62
RFX1MA0509.2chr21:43026135-43026151AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr21:43026135-43026151AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX2MA0600.2chr21:43026135-43026151AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr21:43026135-43026151AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX3MA0798.1chr21:43026135-43026151AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr21:43026135-43026151AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX4MA0799.1chr21:43026135-43026151AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr21:43026135-43026151AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX5MA0510.2chr21:43026135-43026151AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr21:43026135-43026151AGTTGCTATGGTAACA+7.14
Enhancer Sequence
AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT 60
AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGTCAACCAC ATAAAAATAC 120
ACAAGAGTAG CTTACTATAG TTACAATACC ATAGTAATGT ACTTGAATTT TTGGTGATTT 180
TATAGTTGCT ATGGTAACAC CAACTTATAA ACAAATACAC AACAGTTTGC TGTGTATAAA 240
CAAACAGTGG TAAATTATTA CACTTTAAAT GGTTAAACGC GATAGATAGA TAGATAGATA 300
GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGACA GACAGACAGA CAGACAGACA 360
GACAGACAGA CAGACAGACA GACAGACAGA CAGACAGACA GACAGACAGA CAGACAGACA 420
GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA 480
GATAGATAGA TAGATAGATA GATACCTTGG TAACCGTCGG TTGCAGATCC TCCCTCTCAA 540
ACGCGCTCTG TGTCTTGTCT TCAGTTTCTC CTCCACTTTG TAAAGCTGTA AAGTTGGTTT 600
GTTGTTTTGA GGGTTTCTGC TCTTCTCTGT TTGTGGCTCT CGGGCTTCTG GAGCCTCGCT 660
GACCGACACT AAGAGCGTCG AAATCGATGG TTTTGCTCTC ATACGCTCCT TCTACGTTAC 720
AAAACAAACC TCCGTATTTT TGTCGCGCCA CCGGGTCCGC CGTGCTCGGT CGAGCCAGGT 780
AAACCGGCAG ATCATCGTCC CGGTCCAGGC GTCTGCCCTC AGCCATGGTG TGAGACAGAC 840
TGACTGAGAG ACTGACTGGA GATCAGCCAG AATTAAACTT CACACGAGCA GAGCCACTGC 900
CGCACTGTCA CACATCTGCA GACCGGCCGG CTTATTTAGG TAAGCCGATC TTCATTTCGT 960
TCAGTTTTAG CTATCTCTTG TTTAACAGAC GTCCATTTAA CGTTGCAGTT AAAGTCAGAA 1020
TTATTAGCAC TCCTGAATTA TTATTATTAG CCACCCTGTA TGTTTCCCAC CATCCAATTT 1080
TGCAGCACAT TTCTAAACGT AATAGTTTTA ATAACTAATT TCTAATAATT AAATTAGATA 1140
ACTATTAAAT AACTTAATTA AATAACTAAA TCTATTTATT TGCATCTTTG CAATGATGAC 1200
ACTAGCCTAC TGTACATAAT ACTAGAGCTT CAGGATCCTA AAGTGCAATT TTAAGGCTTA 1260
GCTAGGGGAA GGCAAGTCGA TAACAGTGGT ATGAATGTTG CTTAAGGGGC TCATAATATT 1320