EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-18147 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr21:5083556-5084628 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr21:5083607-5083626TATCACCCCCTGCTGGTCA-6.55
FOXE1MA1487.1chr21:5084112-5084127CCTAAAACAAACAAC+6.83
Lhx3MA0135.1chr21:5084035-5084048GGTAAATTAATTT-6.07
PHOX2AMA0713.1chr21:5084042-5084053TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr21:5084042-5084053TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr21:5084042-5084053TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr21:5084042-5084053TAATTTAATTA+6.62
Enhancer Sequence
TGTGTTCTTG TCATGTGTGT GTTCGCCCTA TGCTCGCTTT ATGACCGGTT TTATCACCCC 60
CTGCTGGTCA CGATAGTGTG CAGGACTACA GAATCTGCCC ACAAGATGTC TCTGCACGTG 120
CAAATTCAAA GAAAGAGACA ATAAGGTGTG TTTTCTGAAA TGAAGAGGTG TTTTTTAGGT 180
GTGGTAAATT ATCTAAACTT GATTTTTCGA CTTACAAAGA TCCTAAAACA AACACAACAA 240
CACAATCCTT GATAAGGTAA TTTGTGTCTA AATGTATTTT ATAATTTATA ATTTATCTAA 300
TAGTCCTTTA TATATAGGTA ATAATGTGTT TTTTGTGTTG GGTTAGGTTA ATTTTCCGAT 360
GTACAAAGAT GCTAAAACAA ACACGACAGA ATCTTTCAGG TAATTGTTTG CGCCTAATTG 420
TCTTAATAAT CTAATAGTCA TTTAAATATG TTATTTTATA TAAATAAGAG TGCTTTTGAG 480
GTAAATTAAT TTAATTACAA TTAAAATTAA AGACAATTGT CTGTGGACTT GGAATTTCCG 540
ATGTAGGCTG CATGATCCTA AAACAAACAA CAACACAATC CTTCATGAGG TAGGCCTAAT 600
TTGTTTGCGT CTTGTCTTAT TAATCTAATA GTCATTTAAA TATATGAAAT AATGTGTTTT 660
TTAATGTAAA TAGGAGATTT TATTGAGATA AATTATCTGG ACTTGATATT TCTGACATAC 720
AAAAATCCTA AAACAACAAC ACAATTCTTG ATGAGGCTAT TTTGCGTCTA ATTGCATTTT 780
ATTCATCGAG CATGACTCAC TTTAAATATA AGAAAAGGGG AAAGAAAAAA ATTAAAGTGT 840
GTATCCAAGA GATAGCATAG TTTACAAGAG CTTTTGTAAG TCAGTATGTG TGTATGATCC 900
GGTGTTTATC AGATGATAGC TGTATCAGGT GTTCGTAATA AAGCTAATGG CAGGAGGAAG 960
AATTAGCATG TGGCTTCGAG AGAATTTCAC TTCAGTGACA CTTCAGAACA CGTCAGTGAA 1020
CAAAGCAAAA TCCATATACA CAATAATGCA ATCTACAGGG TTTAGCCTTA GT 1072