EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-17840 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr20:53338508-53339781 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FERD3LMA1485.1chr20:53339260-53339274GTCACAGCTGCCGC-6.51
IRF1MA0050.2chr20:53339117-53339138AAAATGAAAATGAAAAAAACA-6.41
IRF1MA0050.2chr20:53339111-53339132AGAATGAAAATGAAAATGAAA-6.6
Klf12MA0742.1chr20:53339207-53339222GGCCACGCCCACAGA+6.17
POU2F1MA0785.1chr20:53338789-53338801AATATGTAAATT+6.02
RFX1MA0509.2chr20:53338543-53338559TGTTGCTATGACAACA+6.64
RFX1MA0509.2chr20:53338543-53338559TGTTGCTATGACAACA-6.65
RFX2MA0600.2chr20:53338543-53338559TGTTGCTATGACAACA-6.45
RFX2MA0600.2chr20:53338543-53338559TGTTGCTATGACAACA+6.59
RFX3MA0798.1chr20:53338543-53338559TGTTGCTATGACAACA-6.14
RFX3MA0798.1chr20:53338543-53338559TGTTGCTATGACAACA+6.46
RFX4MA0799.1chr20:53338543-53338559TGTTGCTATGACAACA+6.32
RFX5MA0510.2chr20:53338543-53338559TGTTGCTATGACAACA-6.18
RFX5MA0510.2chr20:53338543-53338559TGTTGCTATGACAACA+6.4
SP1MA0079.4chr20:53339205-53339220CTGGCCACGCCCACA+7.01
SP3MA0746.2chr20:53339207-53339220GGCCACGCCCACA+6.64
SP4MA0685.1chr20:53339205-53339222CTGGCCACGCCCACAGA+6.57
SP8MA0747.1chr20:53339208-53339220GCCACGCCCACA+6.22
Enhancer Sequence
GAACCTGCTC CCGATCAGGT TTAAGCTAGC AGAACTGTTG CTATGACAAC AACTCTCGGA 60
TCAGCTTTGA AGAACGAAAC GATCCTGGAT CGTATGGAAG CATATGAGTA GCATAATTCA 120
ATTCAAAATG TAATATGCAA AATGGCAATG CAATATGTTA AATGGCAATG TATTTCTGTA 180
TTTGAATTTG CATTTTCCAA GACATATGAG CAATGTTTGG TGCAGAATGA AAATGTAAAT 240
TAAATTACAT TGTTTGCATT TCTCATTTCA AACACTGTTT TAATATGTAA ATTGTATCCA 300
CATTTTAAAG CTTTATAAGT AGCAAAATTA AATTGAAAAT GCTATACACA AACTGAATTT 360
GATGTGAATA AAGTACAAGC AGAAACTGTA GCAAAATGAT AATTTAAATG TTATTTGTCC 420
TAAATGCATT TACACTCACG TCTAGGAAAC GCAGGATTAC ATTTTCAGCA TAACAGCATG 480
GGATGTGTGT AGCAAAATTA ATTTTGAAAT GTAATATGCA AAACGATAAT GCAATATGTA 540
AAAGGCAGTG TATTTCTGTA TTTCAGTTAG CATTTTCCAA GACATATGTG CAATGTTTGC 600
TGCAGAATGA AAATGAAAAT GAAAAAAACA TAATGCATTT TCATTTAACA CATCGCGATG 660
AATGAAAGCC GATTTGAAAT TGAAAATGCA TTCTGGCCTG GCCACGCCCA CAGACGGCCG 720
CCGTTGCTGC CAGGCGGGTT TTAGGTTATG TCGTCACAGC TGCCGCGAGG ACTATTTGGG 780
ACATTTGGCA GCATAAACAT GGCGAAGTCT GTTCCTCAGC GGCTTCGTGA AGCTGCACGA 840
GCCCTCGAGC TTGAACTGGG AAATACTTTA GAAAACCAAT CACCTCCTAG CTCAGTAAAC 900
TTGGCTTAAG GTTTGATATT CGCGCACGCA GTTTTAGGGA TCATCTGCAA ATTACATCGA 960
CAGAACCTAA AGGGGCTTTA GCTGATGTGT ACTGTATGCT TGTGACAAGA GCTATTGCCT 1020
ATTTCTGCAT TGTATGTACC ATATAGTTAG AGGTATAGTA GCTTTGCTAC CTGTATTAAA 1080
TCAGTCTGGC CTCTAACCAT TTATTGGAAT CTCCTCAATT TTTTTCTGCT TTGCGTTACT 1140
GTGCGTTTTG GTTCTGTTGA TGTAATTTCA GGGCTGATAG TGGAAAAAAT TCCTGAGCCT 1200
GAACTTTTTT TCCTTGCCCC TGAGGTGAGT AGGGGTGGGG GTACTATGTA TGCAACGCAC 1260
TTTTAACACA TAA 1273