EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-17831 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr20:53201048-53201802 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr20:53201738-53201751TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr20:53201742-53201755TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr20:53201746-53201759TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr20:53201739-53201752AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr20:53201743-53201756AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr20:53201747-53201760AATTAATTAATTT-6.92
POU6F1MA0628.1chr20:53201740-53201750ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr20:53201744-53201754ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr20:53201748-53201758ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr20:53201740-53201750ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr20:53201744-53201754ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr20:53201748-53201758ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
TAGAGATGAA GGGCATGGTG AGGGAACAGT GGGATGAAGG GGAAGGCAAG TAAGAGGATA 60
AACGTAGAAC AAGTAGGTAG GTTGATCGGG TGTCCTACGA TAATGCTCAG AGACTCAGAG 120
TGGGGGTACT GTCTCTGTAA TATATTAGTA GGATGATTGG ACCCCGGCGA GGCAGTGGCG 180
CAGTAGGTAG TGCTGTCGCA TCACAGCAAG AAGGTCGCTG GTTCGATCCT CAGCTCAGTT 240
GGCGTTTCTG TGTGGAGTTT GCATGTTCTC CCTGCCTTCG CGTGGGTTTC CTCTGGGTGC 300
TCCGGTTTCC CCCACAGTCC AAACACATGT GGTACAGGTG AATTGGGTAG GCTAAATTGA 360
CCATAGTGTA TGAGTGTGTG TGTGAATGTG TGTGTGGATG TTTCCCAGAG ATGGGTTGTG 420
GCTGGAAGGG CATCCGCTGT GTAAAAACTT GCTGGATAAG TTGGCGGTTC ATTCCGCTGT 480
GGCGACCCCG GATTAATGAA AGGACTAAGC CGACAAGAAA GCTAACTACA GACAATTTAG 540
CTTATCCAAT TCCCCTATAG CGCATGTGTT TGGACTGGGG GAAACCCGAG CACCCGGAGG 600
AAACTCACGC CAACATGGGG AGAACATGCA AACTCCACAC AGAAATGCCA ACTGACCCAG 660
TCTAGGGCCG AATTTCAGCT ATTGATTTCT TAATTAATTA ATTAATTAAT TTCTTATTAT 720
ATGCTTGAAT AGTTCATGAA AGGTTCATTC TGCT 754