EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-17666 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr20:48077486-48078815 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr20:48077996-48078015TATCCACAAGATGGCGCTG+6.65
Hmx2MA0897.1chr20:48078179-48078196AAAAACACTTAAAAAAT+6.01
LMX1BMA0703.2chr20:48078106-48078117TTAATTAAAAC-6.14
Nkx3-2MA0122.3chr20:48078179-48078192AAAAACACTTAAA+6.64
Enhancer Sequence
AACTTGGACC TTTTTATATG TAACAGGAAA AAAAAGCTGC AACCCATCTC TGGGAAACAT 60
CCATACACAC TCTTTAACAC TCATACACTA TTGACAATTT AGCCTACCCA ATACACATGT 120
ACGGAATGTC TTTGGACTGT GGGGGAAATC AGAGGACTCG GAGGAAACCC ACGCAAACGC 180
GGGGAGAACC TACAATCTCC ACACAGAAAC GCCAACTGAC CCAGCCGAGC CTCGAACCAG 240
CGACCTTCTT ATTGTGAGGC GACAGAACTA CCTACTGCGC CACCGCGTCG CCTAAAACAA 300
TGCATAAAAA TAAAAAATAA AAAATATTTA TTTGAAAAAA ATCTCCTCTT TGCACACCTT 360
AAACCTAATA TTCGGTTGTG CAGATTCACG TGATCAGCGC CCCACGTCAC CTGTAAACCT 420
GCAGAAACTT TGATGATTTC AGACATATCA GAATCCTAAA ACGTCTCGTT TGTTTCCAGC 480
TGTAAATGGA GGTGTTGAAT GGCTGATTTG TATCCACAAG ATGGCGCTGC TGACTACCGC 540
GAGACGATAA AGAAAAGAAT CACTCAACCT TTGAACTCTT CAGTTGAGTC AGAACATGGC 600
TGCCTGAATC CCAATCACGT TTAATTAAAA CACTAAATGA AATATCCTAA ATAAAATTGG 660
GATTACAGCA TCAAATATCA GCATACTGGA AAAAAAAACA CTTAAAAAAT GCCCGGATTA 720
TATACAGAAA TGGAGTTCAC ACAAGCTGTC AGGCCTACAA ATGCCTTCCG TGAGTACTCA 780
TTTTCGTGTT TTTAAAAGTT TAGACAAAGT TGATGGTTAC AAGAGTGTTC AAATATATTA 840
AGATATAACA GTTAGTTGTT GTCGTGCATT CATGATTTTG TTGTGTTCCT GGAGCTCAGC 900
CAGAAGTGTT TTAACTAACT TCAGGCTTAT TTGTTTACAA TTAAAGCCGA GGTGTATTGA 960
AGTATATTCA CACATTCAGA CTTTCTATTT AATAATATAA TTTCAGAATT TTTTTTTTCA 1020
TATTATAAAT AATAAAATCA TAGGCTAACT GCCAATGACT TTCATAATAC AACATTGTTC 1080
AGTCAATTAA ATAGTGCTAA TGCTGTTTTG ACGTCGTACT TGCATGTTAT TTCAGACTGA 1140
ATATTCAAGG TTCAATAGTC TCGTAAGCTG TATTTGATCA TATGGCCTTC CTTTCTTGCT 1200
GATGTGTGAC TATAAAGCAA AGAAACGTCC AACTAAACTT TCAGCCTTTC ACAAACAAGC 1260
TCTTTTAGCT TGCAAATTAA TATACAAACA CAACATGTCC CTACATCAAT GTTATATTTG 1320
GAACAACTG 1329