EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-17604 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr20:46407139-46408577 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr20:46407513-46407532CAGCCACCAGGGGGCGCGC+7.21
CTCFLMA1102.1chr20:46407517-46407531CACCAGGGGGCGCG+7.14
PBX3MA1114.1chr20:46407900-46407917GATTGACTGACAGGCTC+6.21
Enhancer Sequence
ATTGGCTACC GAAATGCTGG TCAGTGCGTG GTTGAAATAT TATTTTATTT ACAGTAACTA 60
ATTGTGATTT TAAAAGTAAC GAAGTAGATC ACTCAGCTTA ATTTGTACTT AAGTACAAGT 120
AAAATTACAG GCTTAAAATT CTACTCATGA AAGTACAATT ACCCTAAAAA GGTACTTAAT 180
TACAGTAACG TGAGTAGTTG TATTTCGTTA CTCCCAACAC TGGTTGCCAG ATGTAACTAT 240
CTAATTTCAG CCCAAAAACA ATACAAATCC CGCTGAAAAC CACATTTTCA CTGACCGCCT 300
ATATAATTTT TACCCGCAAA ATCGCCCAAT CTGGCAACAC TAGAATAGGC ATAGTGCAAA 360
TGAGATTCAG GATTCAGCCA CCAGGGGGCG CGCAAAATGT TTGTGTGGCT TAATTTTTCA 420
CAACATGTGC TGCACACGAG CTCGAGAGTG TCACATGACT GACAACAGTT TTACAGTTAA 480
AGTACGCCCA TTTCTGAGTA CAGATAGTTT GTGTGATTTC TCCTCTAGTC GTTTATTTCT 540
CCACTGGAGC TTCATCACGG TGGCGAAACT TTTAACGGGT GTTTGAGGAG TCTCTGCTGC 600
GGGAGCCGGA CGCTTTATTG AAACTAAGCA GCAAATCTGT CATATTAAAA TGGCAAGTTT 660
ATTAACTGGT GTTTAAACTC AAACGTTTTT ATATGATATT TATTTAAAAG TTAGTATTTA 720
TTTATAACAT AGTTTGACAT GTTGTTCAGT GAGTTCCTCT AGATTGACTG ACAGGCTCCT 780
CAACATGACA TTTGGGATTC ATTATGAATG AATGGACACT CGTTTTAACG ACATAAACCG 840
GGTGAAAATG GGCGATGAGT CGAAGTCAGT GGACGGAGAG GTGAATGACA ATACATATTA 900
CTCAAAAACT GATGCTGAGG TGAATTTTGA ACATCGCTAC ACAACGCCAG AAACGCGTTT 960
GTATAAAAAG AGATGGGTCA TAGTGTGTTT ATTCAGCTCA TATTCGCTCT GCAACTCCTA 1020
TCAATGGATT CAGTACGGAA TCATCAACAA CATCTTCATG CGCTTCTACG GCGTGGACTC 1080
TTTCACCATA GACTGGATGT CCATGATTTA CATGTTGACA TACATTCCGC TCATTTTCCC 1140
CGTTTCGTGG CTACTGGATA AAAAGGGTCT GAGGGTCATC GCGCTCGTGG CCGCGGCTCT 1200
GAATTGCGCG GGCACGTGGA TCAAGGTGGC CAGCGCCAGA CCGGACCTTT TCCCGGTGAC 1260
ATTTCTCGGT CAGTTCACGT GCTCCGTTGC TCAGGTGTTT ATATTGGGGA TGCCCTCGCG 1320
GATCGCATCG GTGTGGTTCG GGTCGGATGA GGTGTCCACA GCGTGCTCCA TTGGAGTCTT 1380
CGGAAATCAG GTAAGATTAT AGCAATAGTT TTGTCAATTT AAAGCTCCCC TGGAAGTA 1438