EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-17376 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr20:33804600-33805752 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr20:33804901-33804914GTTTAATTAATTT-6.28
NFIL3MA0025.1chr20:33805038-33805049AGGTTACATAA-6.14
ONECUT3MA0757.1chr20:33805505-33805519GTAAAATCAATAAA+6.46
Enhancer Sequence
AACACAAGAT GTCTTTCATC AGCCAACAGA CCTTGATTCT CCTGATAAAG AAAAGAAAAA 60
CAGCACAGAT TCAGAAAACC ATCTTTAAGG CTGATTAGCT CATATCAAAT GTATAAATTA 120
AATATTTAGC TTATAATATA TACTGTGTGT CTGTGTATGT GTTGTTTAAG TTAAAAAGCT 180
GAGACTATGG TAGGTAGGCC CACTGTAGAT AATATTCGAC AGAAAACAAA ACGCCCACTT 240
CTCACACACT GAGGAATGAG GAAGCAGAGC GTCTCAGAAA AGTGCCCCCT GGGTGCAACT 300
AGTTTAATTA ATTTTTATGG ACTAGTCTAG AGAACTAACA TAAACAAGCA ATTTCGATCA 360
TTTTGACTAT TTTCGACTGT TTTCTACCTT ATTTTTTTAA ATAATCACAA AATACATTAA 420
ATAGGTTGAA GTAACGTTAG GTTACATAAC GTTTTGCAGA ATGCTGAAGC TATCCGACCC 480
AAATCTTGAA TAATAATCTC TTGTCATTCG TGTTCATTTA ATTGAATGAA TCTCTCTGTG 540
TGCGTGTTTG TGTAACGTTA CTTTTAAACA CACTTTCAAA CTAATAAACT CCAGGCAGTC 600
AAAAACCCAC AACACTGACC TCTGGCGGAG ATGTTGAATG AAGGTCCATT TAGGCACACG 660
GTTACATATA CTGTAAGACA TTGTTCTTGT CAAAATAAAT ACATATAAAA ACAAATAAAG 720
AATGAAAATG AACTTTAATT AAAGTCGACG GTAGTTCACT TCAACAAAAT GAAAATCCAA 780
AGTGCCCAAG TTACCGTTTC CTCTGTCGTT GTTGTTGTCG GCTTGTTGCT ATGACGTCGT 840
CAAACACCTG AAGAGCGGAG AGACATGGAC GTTACAATCT ATTGCAGCAG TCTATAATAA 900
AGTAAGTAAA ATCAATAAAC CACGACATAT GATGTAAAGA AACCCATTAA AGCATATAGG 960
ATACACATAT AACGTTATAG AGAGTAAAGA AAATATGAAG TAATGTGACG CGCGATACGA 1020
TGGCTTGATA AGTTAACTGT TACTAAACGT AACAGCTTTT GATTCATTTA ATATAAAAAC 1080
AGATTACTAA CGTTAGATGT GTAACGTTAC TTCTGTTCAC AGACACATAC CATGTCATCT 1140
GACTTAATTG TG 1152