EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-17236 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr20:28737452-28739433 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr20:28738446-28738456AACAGCTGTT+6.02
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr20:28738446-28738456AACAGCTGTT-6.02
GLI2MA0734.2chr20:28739069-28739084CGGCGTGGGTGGTCG-7.42
GLI3MA1491.1chr20:28739069-28739084CGGCGTGGGTGGTCG-7.51
MSCMA0665.1chr20:28738446-28738456AACAGCTGTT+6.02
MSCMA0665.1chr20:28738446-28738456AACAGCTGTT-6.02
MYF6MA0667.1chr20:28738446-28738456AACAGCTGTT+6.02
MYF6MA0667.1chr20:28738446-28738456AACAGCTGTT-6.02
MafbMA0117.2chr20:28738370-28738382AATATGCTGACT+6.52
RREB1MA0073.1chr20:28739189-28739209TGGGTGGGGGTTTTGGGGGT-6.06
RREB1MA0073.1chr20:28739187-28739207AGTGGGTGGGGGTTTTGGGG-6.73
STAT1MA0137.3chr20:28738174-28738185TTTCCTAGAAA-6.14
Tcf21MA0832.1chr20:28738444-28738458ATAACAGCTGTTAG-6.59
Tcf21MA0832.1chr20:28738444-28738458ATAACAGCTGTTAG+6.61
ZIC1MA0696.1chr20:28739018-28739032CTCAGCGGGGGGTT-6.03
ZIC3MA0697.1chr20:28739017-28739032ACTCAGCGGGGGGTT-6.33
ZIC4MA0751.1chr20:28739017-28739032ACTCAGCGGGGGGTT-6.1
ZNF384MA1125.1chr20:28738554-28738566TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
CAGTCTTTCG ATGTGATTCA GTTATTTTGT GGTTCTGTGA CGGCTGGTGT TGGTTGCTGT 60
ATGAGTAAAA ATTATTACAG TTTACGTAAC TAGATTAATT TAAATCAAAC AAAATAAAAT 120
ATGAATGTGA CTATTTTCAA TTTAATAAGG TTTTGTTCGT TTTGGCAGGT TTTGGACAGC 180
TTTTGGGCTG GAAAAAGTCA ACTAGCCTAT ATCTGGCAAC ACTGTGCTCA AGTGTCACAA 240
TTCGCGCCAA TTCTAACATG TCAGAAAACA ATTGGCTACA GTAAAACAGG TTGTAAACAA 300
TTTTTTCTGG TATAATAGCC TGCGATTTTA CACGAGGTCT AAGTGCTTTA GCCCTTTTAA 360
TGGCTTAAAA TCGGTAAGGT TCCTTAGGTG TCATTTGCTT TGACCGGGGA GGAATTCAGC 420
TTTCCACACG TCTAATTGGT AGCTCAGAAA GCGATTTAAT CGACCAGTCA TAAATGGAGT 480
CAACAAAAAC AGACTGGTTT TTAGATTCAG ATAACAAAGC AGGTATGTCG ACATACACAA 540
CTTTCTATAC AGCTACATGT ATTTCTTTTA AAAACAATAA CACATAGAAG TAGCTTACTT 600
ACTACCCGTT TTAGTATTAG AGCTCGTAAG CGAATGACGC ATTACAAAAC ATTACTCGAC 660
CAAATAAAAC CATCAATAAA TACAAACATG AACTCAAATG GTCTTAAAAC ATCACCAAAA 720
ACTTTCCTAG AAAATTTTAA GATGGTTTTT ATCATCGACT TATCTCAATT TAAAGAAATG 780
GAAAGTGTCT TAGTTGCTCA AAACATATAA AGAAATATAG CCTACACACA TTTGGTGTCC 840
ATTGCTGTGT ATCAACTGCA CGAGTTCCAC AGACACATAC ACAAACATAA AAGACTCAAT 900
CGTCTGCTCT TCTTAAACAA TATGCTGACT TATTTTCAGT AACCCTGGAT TGCTTTTCCA 960
CACCGTCCAC ACGAGGAGCG GCGCGCGCGC TCATAACAGC TGTTAGTGAT CAACACCAGC 1020
GAACCTAAAG GTAGAAATGT TATTAATTTG CGCGTGGGCA TGATTTTCTA GAGCCGCATT 1080
GCACTACAAA CATGTGCAGC TATTTAAAAA AAAAGACAAA CAGCTGCTTT CAGAGCGCAA 1140
TTCCCGCAGG AGCACCGGTC CCAATTCACA CAGCACTCCA CAGAGCGCGA TGCCGAATAT 1200
AGAGGCAGAA AAACCCTGTC ACTGAAAGAC ACGCGCGCGC ACAGCAGGGA GCGCGAGGCG 1260
ACAGGATGAT TCACTTCAAA CTCACCAGCA CTTCGGGAGC CACTCGAATC CAGCACTGGA 1320
CATGACAATT GATCACTCCT GCGGGTCCGA ATATTGCTAT AAGTTTACAG CAGCACAATC 1380
ACACACAAAC AACTGCTGAC TGAAAGAGCG CAATACCTTT GTAAGTACCG CCTCGTCCAC 1440
TCCCGAAGCT CGATTTCCTC CTCCTTAGCA ACCAGAAAAG AGCAGGTTCA TGATCTAACT 1500
GGCGAGAAGG GTCTGGGATG AGGAGGATGA TGATGGGGTG TTGGTGAGGA AAAAATGATG 1560
AAGAGACTCA GCGGGGGGTT TCTTCCACTC TGTCCGCCTC TCTCGCGCAC TGGAGACCGG 1620
CGTGGGTGGT CGCTGCGTGG ACTGGAGTGG AGTGTTCAGG TACAGTGTGA GGAAGGATCC 1680
TGGCATGTGT GCAGCTGAGT GTGAGAGAGT GTCAGAAACA GGGAGGGAGG ATAACAGTGG 1740
GTGGGGGTTT TGGGGGTGGA GTGTCTCCCT CTGTATTTCT GGCAAGCTAT TCTGAAACAT 1800
GTATTTGTTT GATAAGAGAG TTTTTGCAGA CAGATCAATT TAAATTTGGT CATGTGGTTA 1860
CAGTCAATTG AGTAATCCCC TCTAATCCCT GTATTTGTCT CATTAGTACA TCTATAAAAC 1920
ATTAAAATTA ATTAGAAAAA CAGCGGGTGT TAGGATTAGG GTTTAAGATT AAATGATATA 1980
A 1981