EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-17201 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr20:27526256-27528571 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr20:27528485-27528502AAAAAATAAACAAATGT+6.09
HNF4GMA0484.1chr20:27526267-27526282TGAACTTTGGTCCGT-6.11
POU3F1MA0786.1chr20:27528382-27528394TTATGCAAATGT+6.14
Pou2f3MA0627.1chr20:27528380-27528396TTTTATGCAAATGTCA+6.56
RESTMA0138.2chr20:27528459-27528480TGCAGCACCATGAACAGCTCC+8.3
Enhancer Sequence
CCTGCACGTG ATGAACTTTG GTCCGTTTAA AAGTTTAGCT TGTTAAAATT AGGTACTGCT 60
GTACATTATA ACGGCTTTGA TCGATGTTTC AGACTAAAGC AAGCGTTTTA CAGGCTTGGA 120
AAAAGCCAAA TGAGAGAGAG AGAGAGAGAA AAAAAACAGC TGCTAGGCTA TTGCATTGCG 180
GATTAAATAA TGGTAACAGG TGTAGTTGTG GGATGTTTCT CGTGAGTTGT GACAGTAACG 240
TTAATTCCTA CAACTCGTTT ATGGAAGGAG AGAAAGAGAG ATGGAAGGAG GCGGAGACAT 300
CAGAGCAGCT TTGAATCGAT CCACATGTTG GAGCTTTAGT TTCATGTGCG ACCAGGTGTG 360
CACGTACGGA ACCCCGGAAG GGACGTAGTG GAGGAGAAAA AAAATGGGTG GGTGAAAAAA 420
AATAATGGGT GAAAGAAAAA AAATGGGTGG GAGGAAAATA TATATTTCTA AGTTTTTTGC 480
GTTCTCTCGC AAAGTTTTGC GTTCCCTCGC AAAGATGTTT TGCGTTCCCT CGCAAAGATG 540
TTTTGCGTTA TCTCGCAAAG ATGTTTTGCG TTCCCTCGCA AAGATGTTTT GCGTTATCTC 600
GCAAAGATGT TTTGCGTTCC CTCGCAAAGA TGTTTTGCGT TATCTCGCAA AGATGTTTTG 660
CGTTCCCTCG CAAAGATGTT TTGCGTTCCC TCGCAAAGAT GTTTTGCGTT CTCTCGCAAA 720
ACTGTTTCTC CACAAACACT TCCTGTTCAC TTCACTCACG TAAACCCTCC CGTTTTTTCC 780
GAAATTCTCC CATATTTTAC TATTCTATCC CACTTTCTTT ACTGTGCGCT GATTGTCGCC 840
TTTCACTTTG CAACCTCTGA ACCAGTGAAT GCATGTTTAA GCGCTGACTG ACAGACGCGC 900
TCCATACAAT AAACTGATCC CAGATCAGCG TCTGTACGCG CCATTTAAAG GGACACTTCT 960
GTTATCAAAC AAGTGCGCAG CAAATGAATC TCATGTTTTG TTTAGTTTGA TAACAGAGGT 1020
GTCTCTGTAA GAATGCACAG ATCTATAATG AAAGCAGTCT ATTACTTTAG AAACTGTTTG 1080
TGCTCATTTA AGAGAAAATA AGCTGTTTAA AATAAAAGAT GCAGGACGGA GATGTTTCAT 1140
ATTGTTCAGT GTATTTGTCT GTTTAAACAT ACACCCGCTC CTCTGTAAAT GGCGTGTACA 1200
TACGCTGATC TGGGATCAGT TTATTGTACG AAGCGCGTCT GTCAGTCTGC GCTTATACAT 1260
GCATTCACTG GTTCATAGGT AGCATACGCA CAGTAATGTA AAGAAAGTGG GATAGAATGG 1320
TAAAATACGG GAGAATTTCG GCAAAAACGG GAGGGTTTAT GTGAGTGCAG TGAACAGGAA 1380
GTGTTTGTGG AGAAACAGTT TTGCGAGAGA ACGCAAAACA TCTTTGCGAG AGAACGCAAA 1440
ACATCTTTGC GAGATAACGC AAAACATCTT TGCGAGGGAA CGCAAAACAA CTTTGCGAGA 1500
TAACGCAAAA CATCTTTGCG AGGGAACGCA AAACATCTTT GCGAGGGAAC GCAAAACAAC 1560
TTTGCGAGAT AACGCAAAAC ATCTTTGCGA GGGAACGCAA AACATCTTTG CGAGGGAACG 1620
CAAAACATCT TTGCGAGATA ACGCAAAACA CTTAGAAATA TATATTTTCC TCCCACCCAT 1680
TTTTTTCTTT CACCCATTAT TTTTTTTTTC ACCCACCCAT TTTTTTTCTC CCCCACTATG 1740
TCCCTTCCGG GGTTCCGTAT GCACGCGCGT CTGCGATGAG CAAAGGATGG AGATGGTTAA 1800
ACATATGCCA AAGCTACCGA AGGACAGGAA TGACATTTAG GAATCGCATG CCTCTGGGTT 1860
TCTTCTTAAT ACCTGACACA TGGTTTGATG ATCTCTCGGC GTGTTTTGAT CATTTTAAAT 1920
TGGCTGTAAG ACTCAGATGA CAAGAGGTGT CCCATGGCTT TACATCATGA TTTACCACAA 1980
GATATAGAGC AGAGGGAAAC ACCGGTGGAA CTTGACGCTC TGCTTTTGGA TACGGATATT 2040
ATATTTGGAT TAACCAGTCA TTATTTGAGG AGAAAGCAGC AGGTGATACC CTAGCTTGTT 2100
GTCATGTTGC ATGTTTTGTT GACTTTTTAT GCAAATGTCA AACTTAAACT TAGTAAGTTT 2160
ATCTTGTTTT TTACAAGAAA AAAAATATAA ATGGATAAAA TATTGCAGCA CCATGAACAG 2220
CTCCTTTGAA AAAAATAAAC AAATGTGTTG TAGGCTATTC ATCTCATCTA ATAGCTGTAA 2280
AGTGTGATGT CGACCACAAC GAAACCTAGA TTAAT 2315