EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-17159 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr20:26279641-26281719 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF14MA0740.1chr20:26281190-26281204GGGGGGGCGTGGCT-6.35
KLF16MA0741.1chr20:26280838-26280849GGGGGCGTGGC-6.62
KLF16MA0741.1chr20:26280984-26280995GGGGGCGTGGC-6.62
KLF16MA0741.1chr20:26281192-26281203GGGGGCGTGGC-6.62
NR4A1MA1112.2chr20:26281095-26281105GTGACCTTTA-6.02
Nkx3-2MA0122.3chr20:26281178-26281191TTTAAGTGGTTTG-6.24
SP1MA0079.4chr20:26280837-26280852TGGGGGCGTGGCTTG-7.61
SP1MA0079.4chr20:26280983-26280998TGGGGGCGTGGCTTG-7.61
SP1MA0079.4chr20:26281191-26281206GGGGGGCGTGGCTTG-7.85
SP3MA0746.2chr20:26280837-26280850TGGGGGCGTGGCT-6.34
SP3MA0746.2chr20:26280983-26280996TGGGGGCGTGGCT-6.34
SP3MA0746.2chr20:26281191-26281204GGGGGGCGTGGCT-6.74
SP4MA0685.1chr20:26280835-26280852TTTGGGGGCGTGGCTTG-7.18
SP4MA0685.1chr20:26280981-26280998TTTGGGGGCGTGGCTTG-7.18
SP4MA0685.1chr20:26281189-26281206TGGGGGGGCGTGGCTTG-7.45
SP8MA0747.1chr20:26280837-26280849TGGGGGCGTGGC-6.11
SP8MA0747.1chr20:26280983-26280995TGGGGGCGTGGC-6.11
SP8MA0747.1chr20:26281191-26281203GGGGGGCGTGGC-6.44
Enhancer Sequence
GGTTCTATCA ACATGCTAAC ATGATTAGCA TGTAGCTAGC ATGATACTAA TAGTGTTAGC 60
ATCATGCTAG CAACATGCTA ATCGAGTTGC TAGCATCATA CTAACATGAT TAGCATGTAG 120
CTAGCATGAT GCTAATCGTG TTAGCATCAT GCTAGCAACA TGCTAATCGA GTTGCTAGCA 180
TCATGCTAAC ATGATTATCA TGTAGCTAGC ATGATGCTAA TCGTGTAAGC ATCATGCTAG 240
CAACATGCTA ATCGAGTTGC TAGCATCATG CTAGCAACAG TGCTAGGGTG CCCTAAGTGG 300
TTGCTAGTTG GTTGCTAAGG TGTTGCTAGG CGGTTGCTAA GGTGTTCTAA GTGGTTGCTA 360
GGTGGTTGCT AAGGTGTTGC TAGGCGGTTG CTAAGATGTC CTAAGTGGTT GCTAGGTGGT 420
TGCTAAGGTG TTGCTAGGCG GTTGCGAAGG TGTCCTAAGT GGTTGCTAGG TGGTTGCTAA 480
GGTGTTGCTA GGTGGTTGCT AGGGTGTTCT GAGTGGTTGC TAAGTTGTTG CTAGGCGGTT 540
GCTAGGGTAT TCTGAGTGGT TGCTAGGTGG TTGCTAAGGT GTTCCTAGGC GGTTGCTAGG 600
GTGTTCTGAG TGGTTGCTAG GTGGTTGCTA AGGTGTTGCT AGGTGGTTGC TAGGGTATTC 660
TAAGTGGTTG CTAAGGCGTT GCTAGGCGGT TGCTAGGGTG TCCTGAGTGG TCGCTAGGCC 720
CTTACTAAGG CGTTATTAGG CGGTTGCTAG GTGGTTGCTA GGCGGTTGCT AGGGTAATTT 780
GGGTGGTTGC TAGGCAGTTG CTAGGGTACC CTGGGTGGTT ACTAGGCAAG CCTTACATAC 840
TTGCCTGATG AAATATTTAT ACTTAGTAAG CATTTCTAGC AAGTTACAGT ACATGGCTAG 900
TCAATATTAG CATGTAGCTA GTCACTGCTA GCATGTGTAG CATATAGGAA GTTCCGTTTG 960
CTAGCATGAG TCAAACGAGC CAATCCCCAA GTGTCTACGA TGTTCTGATG CTGAGATATA 1020
GCTGTTGATG AATGGTTGCT AGGGTACTCT GTTTTGTTGC TATGGGCGAG ATTACAAAGT 1080
GAACTTGAAT GTGGTTGGCT GTCCAAGTCA AATGAGCCAA ACCCCAAGTC AATAGGACAC 1140
TGCTAAGCAA AGATATGCAT GTCGGGCAGT TATAATGGCA GTCTATGGGA CCAGTTTGGG 1200
GGCGTGGCTT GTGAGATTCA TTATCATATT GAGATGCTCA TTGGTTGTCT GAGTCAAATG 1260
AGCCATCCCC CAAGCCAATA GGACACTGCT AAGCAAAGAT ATGCATGTAG GGCAGTTATA 1320
ATGGCAGTCT ATGGGACCAG TTTGGGGGCG TGGCTTGTGA GCTTCATTAT CATATTGAGA 1380
TGCTGATTGG TTGTCTGAGT CAGATGAGCC CACCCCCATG TCTCTATGAC ACTCCTATGT 1440
AATGTTATAG ATGTGTGACC TTTATAATGG AAGTCAATGG GATCTGCAAT GGGACATCCC 1500
ACCCCATGTT AAGTCAATGG GGCACTTATT AAGGGTCTTT AAGTGGTTTG GGGGGGCGTG 1560
GCTTGTGAGC TTCAAAATCA TAATGAGATG CTGATTGGTT GCCTTAGTCA AATAAGCCAA 1620
CCCCCAAGTC TGTATGACAG TGCTATGTAC TTTGATTGAC ATATGACATT TATAATGGGA 1680
GTCAATGTAA TGAATGGGAG TCAATGGGCA ATGTAAAGTC AATGGGAACC CTTTTGGGAC 1740
GTCCTAGCAC CCCAGGGGTA CAACCTATAC CCCCTTTCAG GGTATGTTCT CACTTAGGCT 1800
GCAACCCCCT ACAGATGTTG TGAATCCCAT ATTTCTGTGA AATTCACACT CGGCGCTGTG 1860
ATTCGTCAAA GTTCGGCTCC ATGTAAAGTC AATGGAGACT TTGGGACGTC CTAGCTCCCC 1920
AGGGGTACAA CATTTACCGC CTTTCGGGGT GTGGTTTGAA GCCTCCTATA ACCCTCTCGA 1980
GATGTTGCGA ATCCCATGTC TCTACGATAT TCACTGTTGG CGCTACGGCG ATTTCCGGGA 2040
ATAGTATCTA CGAGTGTCTA GAAAATGAAT GGGAGTCA 2078