EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-16975 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr20:20005579-20007789 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr20:20006775-20006792AACATTAATTAATTTAT-6.01
FOXK2MA1103.1chr20:20005615-20005626ATGTAAACAAA+6.32
FOXP2MA0593.1chr20:20005615-20005626ATGTAAACAAA+6.14
Foxj3MA0851.1chr20:20005612-20005629GACATGTAAACAAACAC+6.6
Lhx3MA0135.1chr20:20006777-20006790CATTAATTAATTT-6.54
Lhx3MA0135.1chr20:20006814-20006827CATTAATTAATTT-6.54
POU6F1MA0628.1chr20:20006778-20006788ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr20:20006815-20006825ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr20:20006778-20006788ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr20:20006815-20006825ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
TGACAGATCA AAACAACATT CACGTGCGCT CGTGACATGT AAACAAACAC ACACAAAAAG 60
ACAGCGTGAT CAGACTGGGG ATGTGACAGG ATCAACATAA GTGAATTTAT AAACTTGATG 120
GTCCCGGATC AACATGAATG AATTTATAAT CTTGATGGTC CAGGATCAAC ATCAGTGAAT 180
TTAAATGTTT GATGGTCCAG GATTAACATT AGTGAATTTA TAAACTTGAA GGTCCAGGAT 240
CAACATCAGT AAATTTATAA ACTTGATGGT CCAGGATCAA CATTAGTGAC TTTTAATCTT 300
GATGGTCCAG AATCAACATT AGTAAATTTA TAATCTTGAT GGTCCAGGAT CAACATTAGT 360
GAATTTTAAT CTTGATGGTC CAGAATCAAC ATTAGTAAAT TTATAATCTT GATGGTCCAG 420
GATCAACATT AGTGAATTTT AATCTTGATG GTCCAGGATC AACATTAGTA AATTTATAAT 480
CTTGATGGTC CCGGATCAAC ATTAGTGAAT TTTCATCTTG ATGAACCAGG ATCAACATTA 540
GTAAATTTAT AATCTTGATG GTCCAGGATC AACATTAGTG AATTTTAATC TTGATGGTGC 600
AGGATCAACA TTAGTGAATT TTAATCTTGA TGGTCCAGGA TCAACATCAG TAAATTTATA 660
AACTTGATGG TCCTTAATCA AAATCAGTAA ATTTATAAAC TTGATGGTCC AGGATCAACT 720
TTAGTGAATT TATAAACTTG ATGGTCCAGG ATCAACATTG GTGAATTTTA ATCTTGATGG 780
TCCAGGATCA ACATCAGTAA ATTTATAAAC TTGATGGTCC AGGATCAACG TTAGTAAATT 840
TTGAATCTTG ATGGTCCAGG ATCAACATCA GTGAATTCAT AAACTTGATG GTCCAGGATC 900
AACATTAGTG AATTTAGAAT CTCGATGGTC CAGGATCAAC ATTATTGAAT TTATAATCTT 960
GATAATCCAG GATCAACACT AGTGAATTTA TAATCTTGAT GGTCAAGGAT CAACAGAGGT 1020
GAATTTTAAA TTTTTGATGG TCCAGGATCA ACATTAGTGA ATTTGTAATC TTGATGGTCC 1080
AGGTTCAACA TTAGTGAATT TTAATCTTGA TGGTCCAGGA TCAACATCAG TAAATTTATA 1140
AACTCGATGG TCCAGTATCA ACATTAGTGA ATTTATAAAG TTGATGGTCC AGGATCAACA 1200
TTAATTAATT TATAATCTTG ATGGTCCAGG ATACACATTA ATTAATTTAT AATCTTGATG 1260
GTCCAGGATC AACATTAGTG AATTTATAAT CTTGATGGTC CAGGATCAAC ATTAGTGAAT 1320
TTATAATCTT TATGGTCCAG GATCAACATC AGTGAATTAA AATTTTTGAT AGTCCAGGAT 1380
CAACATTAGT GAATTTATAA TCTTGATGGT CCAGGATCAA CATTAGTGAA TTTATAATCT 1440
TGATGGTCCA GGATCAATAT TAGTGAATTT TAATCTTGAT GGTCCAGGAT CAACATTAGT 1500
GAATTTATAT TCTTGATGGT CCAGGATCAA CATTAGTGAA TTTATAATCT TTATGGTCCA 1560
GGATCAACAT TAGTGAATTT ATAATCTTGA TGGTCCAGGA TCAACCTAAG TGAAATTATA 1620
ATCTTGATGG TCCAGGATCA ACATTAGTAA ATTTATAATC TTGATGGACC AGGATCAGCA 1680
TTAGTGAATT TATAATTTTG ATGGTCCAGG ATCAATATTA GTGAATTTAT AAACTTGATG 1740
GTCCAGGTTC AACATCAGTG AATTTATAAA CTTGATGGTC CAGGATCAAC ATCAGTGAAT 1800
TTTTAAACTT GATGGTCCAG AATCAACATC AGTGAATTTA TAATCTTGAT GGTCCAGGAT 1860
CAACATTAGT GAATTTTAAT CTTGATGGTC CAGGATCAAC ATTAGTGAAT TTATAATCTT 1920
GATGGTCAAG GATCAACATT AGTGAATTTT AATCTTGATG GTCCAGGATC AACATTAGTG 1980
AATTTTAATC TTGATGGTCC AGGATCAACA TCAGTTAATG TATAAACTTG ATGGTCCAGG 2040
ATCAACTTTA GTGAATTTAT AAACTTGATG GTCCAGGATC AACATTGGTG AATTTTAATC 2100
TTGATGGTCC AGGATCAACG TTAGTAAAAT TAGAATCTTG ATGGTCCAGG ATCAACATCA 2160
GTGAATTCAT AATCTTGATG GTCCAGGATC AACATCAGTG AATTCATAAT 2210