EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-16950 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr20:19043112-19044619 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr20:19044293-19044304GTTTTATTGCC-6.32
CDX4MA1473.1chr20:19044293-19044304GTTTTATTGCC-6.62
Gfi1bMA0483.1chr20:19043350-19043361AAATCACAGCT+6.14
HNF1AMA0046.2chr20:19043656-19043671ATTTAATTATTAATT-6.58
HOXD9MA0913.2chr20:19044293-19044303GTTTTATTGC-6.02
NFAT5MA0606.1chr20:19043369-19043379ATTTTCCATT+6.02
NFATC1MA0624.1chr20:19043369-19043379ATTTTCCATT+6.02
NFATC3MA0625.1chr20:19043369-19043379ATTTTCCATT+6.02
RREB1MA0073.1chr20:19043712-19043732GGTTTAGGGTTGGGGTGGGG-6.06
RREB1MA0073.1chr20:19043826-19043846GGTTTGGGGTTGGGGTGGGG-7.7
Enhancer Sequence
ATATTTGACT CTTAAGTCTG TACACTAATA ACCCTACATG GCGATATATT ATTATTATTT 60
TACTTTTTAC TTAATAATTT ACTGTAATAT TAAATAATAT GAGGGAATAC AACGTTTTTG 120
TAAACTTTCA TCTCACCTGT TGGGCTTCTC ATTACGGTTG GAGGTGTAAG AGAAGCCATC 180
GTGTCACTCT GATGATTTTC GTTGACAAAG TCAGTCGTGA TCGTATTAAC TCGAGTAAAA 240
ATCACAGCTG ACATATTATT TTCCATTTGA GATGCAAAAC AAGTCGCTAA AGTCATTAAA 300
TCACTTCTCA TTGACTTGTT CGTTTGTCAC TCTGAGGAAA TTCTGAACTG TATTCTGTCC 360
CGTGACGTAA CGGCATTCTA TTCGTTCTAT TTATTCGTCA TCAAGTTCGT TGAGCGTGTT 420
ATGATATAAA TTCTGGTATA GTCTAGATTG GATATGCGGC CGGTCGGAAG TGTGATATGC 480
ACATTAATAA AGCTGCATTT TTTTGACAAT TATTAATATT TTATTTATTA TATATTAATT 540
TATTATTTAA TTATTAATTT TATAACAATA ATTCATATTT TTACAGTACT GTGAGGGTTG 600
GGTTTAGGGT TGGGGTGGGG GTAGGCGTTA AAAAATACAC TTTATTGGGT AATTTAATTG 660
ATAACCTAAC TAATACTCGG TACAACTACA GATTTTACAT TACTGTGACG GTTGGGTTTG 720
GGGTTGGGGT GGGGGTAGAC GTTAATAAAA TACAACAAAT GAAAAATTTA ATAAATAATA 780
GAAGTAATTC GCGTTAACTT CCGGCCGCAA ACGTACCCGC TCTAGCAACA ACCATAAATT 840
CTGTCTGCAT AAAGTGCATA TAAAAACAAA CCATCGCAAT CTGTTGTTTG AGAGACGAGG 900
CGACATTTGC AGAGCATTTC TGTGCGAATC CTGAGATTTC TGAAGCTGTT TGAGGATTTC 960
TGAGAGAAGA CTAATTTTAA AGAGCACAAT TTCTTTATTC ATTTTTTATT TCAGTTCTTG 1020
TTTTCTGATT ATTTCATTAA ACATTTGTTT TGCTGTACTG TAGCTTTGTT CTTATTTTTC 1080
CTTTTATTTA TTTTTTATTT ACTTTTATTT ATTTATTTCA TTTTATTTAC ATTTATTTAC 1140
TTTGTTTTAA ATTTATTTTC ATATTTTATC TGTGTTTTCG TGTTTTATTG CCGGTTGGAG 1200
GAGATTGTCC ATATCACACA TGGTGAAGAA AGAGGAGGTG AGTGTTTTTA ATTTGTCATG 1260
TGTTTGTCAT TGGGGGGAAT TGACCTTGTT TGAATAAGCT AATCGAGTGA TTCCTGTCCA 1320
TAGCTGTTTC ATTGACAGAG ACAACACAAC TAAACTGAGT GGTGTAGCTT AAAGCGCATG 1380
GCAACTTGAC GCAACCATGA ACTAATTTTT CTTTTCCCCT CACTACATAT CAAATTTTGC 1440
CTATACTCTT CATCACGAGG AAGACAAGGG GGAATCATTA ATAAGTGTGT GTATTATTGG 1500
AGAGGTG 1507