EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-16866 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr20:15404739-15406463 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr20:15404803-15404820ATTCATTAATTAACTGA+6.51
ArxMA0874.1chr20:15404804-15404821TTCATTAATTAACTGAC-6.75
HMBOX1MA0895.1chr20:15406334-15406344GTTAACTAGT-6.02
LMX1BMA0703.2chr20:15405808-15405819TTAATTAAATT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr20:15405809-15405820TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr20:15405809-15405820TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr20:15405809-15405820TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr20:15405809-15405820TAATTAAATTA-6.62
SOX15MA1152.1chr20:15405317-15405327CTATTGTTTT+6.02
TCF3MA0522.2chr20:15406266-15406276AGCAGGTGTT-6.02
ZNF143MA0088.2chr20:15405640-15405656CTCCCAGCATGCATTG+6.21
Enhancer Sequence
TCAGTTTTAA TTGAAGTGTC CACACTACTG AGTGTTCAAG AAACATGGAG CAAAGCTGAA 60
GTAAATTCAT TAATTAACTG ACTAATTAAA TGATAATTGA GGATTAACAA TGAACAAATG 120
AAGAAATACT GAAGGGAAAA AACAAGAACA GAACATACAA AACTTTAGTC ACAGCTTTAT 180
AATGAAATAA CCTGAAGAAC AACAAATGAT TAAATCATTT AAATGATCAG CGGATGATTA 240
AAAACTATAC AAACATCATC CCCAGCTACA CTTATTACTT AATACATGTA TTTTTGTATA 300
ACATTTACTA AAGTTCTTCT TGAGAAAAAA AGTTAAAGTT TTACGTCACC ATCATGGAGA 360
ACAGAGTTTG CTTTAGTTTG GCTCTTAGCC CTGTCATTTT TAACATTTAT ATATCTTGGC 420
TGCTGCAATT GTTAAAAACT TTGTTTAAAA AGCTCCTTTG TTGAGGCAAG CCAGTCAAAA 480
ACCTAAATAA GATCTGGTGA TGATCATGTT GCTATTAAAT GGCAGAGTCT GTTCTCATTT 540
TTTATAATAA AATTTACTGC TCCTATTCAA TGTTTAATCT ATTGTTTTAC ATTATATGTT 600
TATGTTATAT ATATATATAT GGCAATGATT TCTGGAAGTT TTTAAGAATA TTTTGAACAA 660
CATCACTTTG CTCTATGGTG TAAATCGCAC TCAAAGAGAC ATCAATAATC AGCATATGAA 720
CCTCAATAAT GGTGACAACA AATTTAACAA AATTTAACTA AATTAACAGT TTAACTCACA 780
AACAGGCAAC TGAAAGTCTA AACATAAACA ACAGTAGAAT CAAACACAAA TAAAGAAAAC 840
TGTTAGACCA TTATACATTT ATTTATACCG CAATGCATGC TGGGATATTT GTATTGTGCC 900
ACTCCCAGCA TGCATTGCAA CATGAAACAT TTGAGATGTT ACCATTGTTG ATATACAAGG 960
TCTGAGTCAT GAGGTCTGAT AGTGTATTTG TCATAACTGA ACTGTTTTTG TATGTTATTT 1020
CTTAACTGTT AAGTAATTAC GGAGATATCT TTTTTGTTTC CACTTCTCAT TAATTAAATT 1080
AATAGCTGCA ACTTAGCATA AAATCTATTG CATGACACCC TTCATCCAGA TTTATACCAA 1140
AACATTTATC AGAACTAATT TCAGACAAAT AGATTTTTCT ATTTATTGAC TTTCCAACTT 1200
TATTGCTATA GTACAAACGT TTTGCAAACT CTGCATTACA GCAGTTGGAA AGTCTTCTTA 1260
AATGAGTTCA AGGGTGAAGA GCCCAACTAA ATCAGCCCCT CACTCCATTA CGGTGACACA 1320
AAAAACACCT TAATTTCTGT TGGATCTCAA TGAGAATTGT ATGGACGTCA AATCAGTCAG 1380
TAATAAGTGT GTCTGCTGTT GTTTGTGGAG TTGTTTAATG ATCCTCTGCT GAGACTGAAG 1440
CTGTTTTATT TTATTTTATT TAATGCTGTA ACTCAAGTCA CTGTTTGTAT TTCTTGTTTA 1500
TTTACTTCAG TAATTGTAAT TATTAACAGC AGGTGTTCAT CAGTGTCTGA ATTCACTCAT 1560
TAGTGTTCAT TAAAACTGTC AGGTGAACTA TATTAGTTAA CTAGTGTATG AAATAGTGAA 1620
CAAGGGCACA AAGTGTGATT TTAAACACAG ACTTCAAAAC ATCGAATCTG AACTCTGTTA 1680
GCTCACAGTT TTCTGCAGTT GGTTACTTTC TCGAAAACAA AAAT 1724