EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-16743 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr20:12749456-12751069 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Ascl2MA0816.1chr20:12750433-12750443AGCAGCTGCT+6.02
Ascl2MA0816.1chr20:12750433-12750443AGCAGCTGCT-6.02
Lhx3MA0135.1chr20:12750445-12750458GTTTAATTAATTT-6.28
MAFGMA0659.1chr20:12750077-12750098TTTGTGCTGATTCATCAATGT+6.05
MAFGMA0659.1chr20:12750077-12750098TTTGTGCTGATTCATCAATGT-6.13
MAFKMA0496.2chr20:12750078-12750097TTGTGCTGATTCATCAATG-6.08
MAFKMA0496.2chr20:12750078-12750097TTGTGCTGATTCATCAATG+6.17
PRDM1MA0508.2chr20:12750385-12750395GTGAAAGTGA-6.02
YY1MA0095.2chr20:12750371-12750383TCCGCCATTTTG-6.11
YY1MA0095.2chr20:12750593-12750605CAAAATGGCCGC+6.44
YY1MA0095.2chr20:12750275-12750287CAAGATGGCGGC+7.22
Enhancer Sequence
CAACAGCAGC GCCCAGCAAC CATAGATATA TACACTAGAT ATCGCATAGG GACCCTGAGC 60
ATGCGTCAAT AGCGCCGCCA CATTGGTACA GTGCTCCCGG GACAAATGTC ATTCAACCGC 120
ACTAGTCAAG ACAGTGTTAT TACGTGAAGA TGCGGGACTT TAGCGCTGTC TACAGGTGTA 180
GTAACGAGCA AACAAAGAAA AAAAGCATAA AGGCAGAACA TTTCATAGGT AATATTAGTT 240
TTTTTTTTGT TATTGTATGT TCTGAACTTT TGTGCTAATC GGGTAACGTT ATTGATGAAA 300
ACAGTCACTT ACTGCATTCA CAAGGCAAAG CAGCTCCAAC TCGCACTAAA CACTCGGCTT 360
ATGCTAGTTT TGTTGAATAA AATCAGCAAA CAATGCAAAA GAAATATGAC AACGAGATGC 420
TGCGCAGCCA GAACTTGTAT TGTCGCCTAA CGTTAGTGTA AGAGATCGGG GGATTCATTC 480
ACAAACGAAT CGCTATCTCC GTCAGTATGA GAAGTGAAAG CAGAGGAGGT GTGTTTCAGG 540
ACACGGATTT GATTAAATTT AACAGGGAGG GTGAATAGTA AATTTCTGTA CACACAACAC 600
AAGCTTTTTG TCAGGAATGC CTTTGTGCTG ATTCATCAAT GTAGAAAAGT GATGTAAAAT 660
TATAATTTTC GTAATTAGAA AAAAAATTAC ATACTAACAT CCAGGAAAAC TCCCGATCAT 720
AGATATATGT GTTTATGTGT ATATCTCTGG CTTTGCATGG CCACAGTCCT CCACTGTACC 780
TTGGTCCCGC ATTCATTTCA AAGGAGCGCT ACTCTGTAGC AAGATGGCGG CGCTATTGAC 840
GCATTCCGTC CAATAGACAA CAATTGGCCA GACGACATCT AGTGTATATA TCTATGCCCA 900
GCAACAGTCC TGGATTCCGC CATTTTGGAG TGAAAGTGAT CGGCCGTCCA TTGGATCTCA 960
TTACTGTCGC GATGGCAAGC AGCTGCTTTG TTTAATTAAT TTATTTAAAA AGCGCAATAA 1020
AGCTGAGATA CAACCCGAAA GACAACAATA CAACACTTAC TATCACGACC ATCAGCACTT 1080
TTAATAGTTT ATTTTACAGA CTTATAATAT GCTGTTGTTC CATTGGAGTT TTCAGTCCAA 1140
AATGGCCGCC AGTGGCCCTC TAGTGGCCGT TTACCAAATT ACACTAGAGT GTCGCCTCTT 1200
GGTCATTCTA AGCTCTTTGG TGAAACCAAG GAAGCGAAGC TTTGATTATA TTAACGTAAC 1260
GTTAACCAGT CTCCGTAAAC TCTCGCAAAT AAAAAAAGTC GAAAATGTTT TAGTACAAAA 1320
ACATCTAAAG CTTCTTGACA ATAAATTATC TGAAGCAATC TTACAACGAC GTAAGCTAAA 1380
GGTGTGCATC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTTTTTATT TAAGGAAATT AGATAGAAAG 1440
ATTTTAGTAC AGTTAAAGGG AAAGTGCTTT ACAAAAATAT TGTGAAACTA AATAATAAGT 1500
ATACTTTGAA AGAGAGATCT GACACTGTGT GGATAGATAA ACTGTGTTGA GCAGAAGAAG 1560
AAAAACTGGA ATGGAGAATA TTGTATAAAC CACCATTGAA TAAAAGATCG GGG 1613