EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-16729 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr20:12535116-12537572 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr20:12535590-12535601ATATTTACATA+6.62
FOXC1MA0032.2chr20:12535590-12535601ATATTTACATA+6.62
JUNMA0488.1chr20:12536047-12536060TAAATGATGTAAT-6.1
Lhx3MA0135.1chr20:12535911-12535924GGTAAATTAATTA+6
Lhx3MA0135.1chr20:12535914-12535927AAATTAATTAATC-7.82
POU6F1MA0628.1chr20:12535916-12535926ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr20:12535916-12535926ATTAATTAAT-6.02
ZNF24MA1124.1chr20:12535558-12535571GAATGAATGAATC+6.74
ZNF24MA1124.1chr20:12536282-12536295GAATGAATGAATT+7.22
ZNF24MA1124.1chr20:12535782-12535795AATTCATTCATTC-7.22
ZNF24MA1124.1chr20:12535554-12535567AAATGAATGAATG+7.34
ZNF24MA1124.1chr20:12535786-12535799CATTCATTCATTT-7.34
ZNF384MA1125.1chr20:12537182-12537194TTTTTTTTTTTT+6.22
ZNF384MA1125.1chr20:12537184-12537199TTTTTTTTTTTTTAT+6.27
ZNF384MA1125.1chr20:12537183-12537198TTTTTTTTTTTTTTA+6.37
Enhancer Sequence
TATTATGTCT AGAAATGTGT TGATAAAATA TTCTCTCTGT TAAACAGAAA TTGGTGAAAA 60
AAATAAACGG GGCTAATATT TCTGACTTTA ACCGTGTATA TAGGTGACGC AGTGGGTAGC 120
ATGTTCACCT CACAGCAAGA AGGGGGTTGG TTCGAGCCTC GGCTGAGTCA GTTGGCATAT 180
CTGTGTGGAG TTTGCATGCT TTCCTCGTGT TTGCGTGGGT TTCTTTCGGG TGCTCCTGTT 240
TCCTCCACAA GTCCAAAGAC ATGTGGTACA GATGAATTGG CTATGCTAAA ATTGACCGTA 300
GTGTATGAGT GTGAATGGGT GTTTCCCAGT GATGGATTGT GGCTGGAAGG GCATCCGCTG 360
CGTAAAACAT ATACTGGATA AGTTGGCGGT TCATTCCACT GTGGCGACCC CAGATTAATA 420
AAGGGACTAA GCCGACGAAA ATGAATGAAT GAATCAATAT ATATATATAT ATATATATTT 480
ACATATATAT TAGTTACATA AGTGGATAAT AACAATGGAA TGACACAAGG AGAAAGTACT 540
GAACTACTGA AATGTATTTG ATACTTCATA CTACTGTATA TTATAGTAGT AGCAGCTTAA 600
AGACGATTAA AATTTTTGAG GTAACTGTTA CTTACCCCTA ATCTCATTCC AAATCTAAAA 660
GAAATTAATT CATTCATTCA TTTTCTTTTC GGCATAGTAC CTTTATTAAT CCGGGATCGC 720
CACAGCGGAA TAAACCGCCA ACTTATCCAG CATGTTTTTA CGCAGCAGAA GCCCTTCCAG 780
CTGCAACCCA TTTTTGGTAA ATTAATTAAT CTTATGAACA CATAAAATAT TTTTGTTATG 840
AAGTATTAGA GAAGTGCCTA AAATATACCA TAGTTATTTT AAAATTTAGG ATGACCAAAA 900
GCCTTTGAGT TTGCAACTTA ATGTGGGTAA GTAAATGATG TAATATCGTT ATATATGTAA 960
TGTTTTTAAA CATGATAACA AAATGCTTTA TTTTAATGCG TAAGATAAAA CTTTTATTTA 1020
TAAATATTTA TTAAACAGTT TGCGATTGCT AACAGCCAGT GAATACAAGT GAGAGGAATT 1080
TAAATCTGTT GCCTAGTAAT TTGTACATAA ACATCCCTTC TGTTTTTGTA GGGTTTAAAG 1140
TTTGATAATT AAAATTGTCA TGACAAGAAT GAATGAATTT GCACCATTTT AGCATTGCAG 1200
TTTAACAAAA TAGTGTGCTT TGAACTTAAA CTTGGTGGTA AATGAGCTAT AGTTTAACTA 1260
CAAGAAATTA GCCAAGAGAT TCTAACTAAT AATGCAGCAT TTTTTTTAAA GTTAATTACA 1320
GAGTGAAAAA TCCCTAGACA AGTCTGAAAA TTTGATTCAG GAAAAGTATG CAATTTTTTA 1380
AATGGAATTT GTGTAGTGTT TATACATGTA GATAAAAAAA ATTAACATTG CTCCATTGCT 1440
CTAATAAATT AAATTGCCAC AAGTATTTTT ATAGACTCAC AATATTTGAC TTTATTTTAA 1500
GGCTGCATGG CTTTTGACTA TTCAGAGTTT TTGAAAAGGT TTAACTTAAA TTTCTTTTCT 1560
ATTTTTTCAG TATGGCAGAG GGCGTTTTGG AGGTCTGTGG AAAAGGAAAT GCTGGTTATT 1620
TGGAATGGTT GAAATTTTGC CTTCCCGAAA ACCTGTTTTC CAGCTGGTGG ACAAACGGGA 1680
CAAGAAGACC CTTATACCAA TCATAGCAAA ACATTTCAAG AAAGGCAGCA TCATTCATAG 1740
TGATGAATGG CGTGCACACT CAAGTTTTTC AGAGAGGATA CCTACATCAC ACAGTGAACT 1800
ACAGCATTAG TTTTGTTATT CCATCATCAC GGGTACATAC ACAATACATT GAAAAGGCAT 1860
AGGCAAACTA CAAAAGGGAA GTATGGAGAC TGCGTGCAAA CCGGACAGAA AAGTCGCTGA 1920
AAAACCATCT AATATATATA GAATGGACTT ATTGGTTGGG TAGGAAACAC AAACAAGGGA 1980
TTCTTGGAAG GCTTATACAT GACATCAGTC AGCTCTACCA GTGTGTGTGT ATACAGTTAA 2040
GGTCAGAATT ATTAGCCCCC CCTTGATTTT TTTTTTTTTT TATGTTTTCA AAATGATGTT 2100
TTAACAGATT CAGGAAATAT TCACAGTATG TCTAATAATA TTTTTTTCTT CTGGAGAAAG 2160
TCTTATTTGT TTTATTTCAG CTAGAATAAA AGCAGTTTTT AATTTTTAAA ATCCATTTCA 2220
AGGTCAAAAT TATTAGCCCC TTTAAGCTAT ATATTTTTTT AGATAGTCTA CAGAACAAAC 2280
CATCATTATA CAATTACTTG CCTAATTACC CTAACCTGCC TAGTTACCCT AATTAACCTA 2340
GTTCAGCCTT TAAATGTCAC TTTAAGCTGT ATAGAAGTGT CTTGAAAAAT ATTTAGTCAA 2400
ATATTATGTA CTGTTATCAT GGGAAAGATA AATAGAGTTA TTAAATCTAT TTTGTT 2456