EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-16670 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr20:9106167-9107276 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXP1MA0481.2chr20:9106317-9106329TTCTGTTTACTG-6.02
Lhx3MA0135.1chr20:9107226-9107239CATTAATTAATTA-6.46
POU6F1MA0628.1chr20:9107227-9107237ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr20:9107227-9107237ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
TTATTATTAT AATGAGAAGA CTTCTTGCTA AAGAGCATTT TGTTTCCCAT TTGTTGGACT 60
GAGTTTGTGT GTCCTTTTTC TCCCTGAGAT ATTTTGTTTT CTATAAAAAA AATTATCTGC 120
TTTTGTTTTG TTTTTGTTTT TGTTTTGTTT TTCTGTTTAC TGGCCACGTC AACATGAACT 180
AAACTATGTA TTATGTTGAG AGAGAGAAAA AAGTTACATG AAAATAAATA TTTCCCAAAT 240
AATATTTTAG ATCTATTTGC GTAAACTGGA TTTTTACACC ATAACAGGAC CTTTCAACAT 300
TTTAAAATGA CAAGGCTTTC TCGTTTAAGC ATATTCTCAT ATTCTCAATG GTGTTATGTC 360
ATACATATGA TTGAAAAGCT CCATTTTAAA TACTCACCTG CCCAGTATGA TGGCCATGAT 420
CTTCTGCAAG GGCTTCAGCA CCATCCATAG CAGCGGTAAA GCAGGTAAAG CTCTCCGCCT 480
GCCGGAGGTG TGGAAGCCGC GCGTGCGCTG AAAGACCACC GGCGCCCGAA GAGCTGCTGG 540
AGCTCCAGTC TTGAATGAAC TTGAACATAA ACCGAGTCTG GAGGACCCGA GACTGACACA 600
TGAAGCAGAG AAACTGACAG ATCCTTTTAG CTTTGGTAAG GAAGAGGAGT CTATCTTTAT 660
AAAGTAAGTC CGAGCAGATA TAAACAGTGA CGGACGGCAG TGAAAGAGTC TCTGTGCGCA 720
GCATCTGATC GCTGAATGTG TCCGAAACCT AGTTAAAGTG GACAACATGT CGAGTTTGAC 780
AAGGCGAATA CAAGTCTGCT GCATTCTGAA TCTACAGTAC GCTTAATTTT CAAGTTTTAT 840
CTTGTTTGCT AATTATAGTG GCCAGCAAAG TCACAGTTGT AAGCACATAT GGCTACATTA 900
TGCAATAAAA TGACACAATA TATATCTAAT GTCACTCTTT TGAAGCAAGT GCTGATATGT 960
GAAGTCCACA TAAGTGTTAT AATCGACTGA CGTTACATTT CAATTAGATC GCTAAAACTT 1020
CGAGTGTGGC TAACTCCTCT AGAGCGCAAT AATTATGCTC ATTAATTAAT TATAAAGTTT 1080
ATATCTGTCT GGTTTGAGAA GTTCTTCAT 1109