EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-16610 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr20:6017372-6018500 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr20:6018031-6018044AAATAATTAATTT-6.78
POU4F1MA0790.1chr20:6018029-6018043TTAAATAATTAATT+6.01
Enhancer Sequence
CCATCGATTC GGTTCAATTC GATATCTCAA TGCATTGATG ATGCTTTTCA TACACAGTTT 60
TATATTGGGG GGTTTGGGGG AGGGTATAAC AAGCTGTCTG TATAAACACA CACATTCATG 120
GACACAAAGC ACCAAGCAAG CGACACACAG CATCACGCTC TCTCTCATTC ACACACATAA 180
ACACACACAC GCACGCCTGC TTGCTCGCTC GGGTGCGATA TTGCTAGACC GCCCACTTCC 240
GTTCAAATTA CACCAGAGTA ACCGACCACT TTATTTGTAA AATTTATTCC ATCGCCACAA 300
GAAATCTGGT CAGCTTCCGT GGTACAGCCG TGGGAATGCA GACCTCTATC CAGAAGTATC 360
GCTGTAACAG CCGAGAGGAG AGGAAAAGTC ACACCAGCAG GTCAAATGAG CCACAGTGAG 420
AGAGGGAGAG AGAGAGAAAT AGAGTTTACT TTCATTCTCT CAATCGCTGT GAAATAGGGA 480
CTTCTGCTGT GTCAGTGAAA GACTGTCCAG CAAACACACA CGCAGTGAAA TTATGCACAG 540
CTTCTATGTT TTTAAGTAGT TTTCAAGTAG CTTTAAGTAG CCTCCCTCGC CTTTGTAAGC 600
TACGGCGACA TTGCACATAT GAGATAAATG ACGTCAGTAC ATAATAACCG CTTATGATTA 660
AATAATTAAT TTTTGTCACA AACAAAGAAT GTTCAGATGG ATCCAAGTGC AAGTGAAAAG 720
ATAATATTTA TTGACACAGT CAAGATAAAT GTAACGAGTG TGTGCGGTGC TAGGGCTAGG 780
AGAAACCAGA ACAGGGATCA GACAGGAAAA CAGGGTTCAG TGGTAACTCC GCACGGTCCT 840
GGGCACAGAC AAATGCACAC TTAAGCACAC GTAACGAACT GACAAGAAAA CACAGAAAAC 900
GTTGCACATA TATAGGCACG ATAATGAGCC TCAGCTGGCG AACTAATCAA ACCAACTAAG 960
TGCCGTCATA ACACGTGACC AAAACAAAAC TAACCCACAT GATCAAACAG ACGCTCCGGA 1020
AGAGCGCACA AACCTGCAAC CGTGACAAAT TTTGACAATT AATTTTGACA CCCCTACTCA 1080
CTAGATCCTC CCGTATAGGC ACGGGTCCAT TGCAAAAACA CTCACAGG 1128