EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-16536 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr20:2390527-2392575 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HES2MA0616.2chr20:2391127-2391137GGCACGTGCC+6.02
HES2MA0616.2chr20:2391127-2391137GGCACGTGCC-6.02
HES5MA0821.1chr20:2391126-2391138GGGCACGTGCCG-6.14
HES7MA0822.1chr20:2391126-2391138GGGCACGTGCCG-6.02
NKX2-5MA0063.2chr20:2392107-2392117CTCAAGTGGT-6.02
Nkx3-2MA0122.3chr20:2391016-2391029AAAAACACTTAAA+6.64
Enhancer Sequence
GGTTTTATAT TTGCACATTC ATTCAGTTAC AACTTGTGAC ACACACCCTA TATAGTTTAC 60
CATGGTACTT TGAATATTCT GTCTGAAATC ACTTGCAAGT ATGACTTGAA AACAACATTA 120
GCACTATTGA CAATGTTAGA TAGTCATTGG CTGCTAATAT GATTTCACTA TTTAGAATTT 180
GCAAACAATA CTAAGATTAT ACTATTAAGG AGAAAATCTG AATGTGTGAA TATAAAACCA 240
ACTTTAGCCC AATCATTACG TCAATGAAAG TCCCCACATG GATATAGGAA CAAGTCAGTG 300
TGAGAAATAA ATCAGAGTAG CGTTTTTGTA TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 360
TGTAGCAGAG AGCACATCTG GACTGAAGCT CTGCCGACAC AAACTAAAAA AAAGCTCGCA 420
GCGAAGATGG CGCCGCGTCA TCCAGTTTAT TGCGTATTCA TGTGCACGTA AAGCCAACAC 480
CACCAGAGAA AAAACACTTA AAACACACAA CGAGGTCGAC ACACACACAG TGATGTGCTG 540
GGGTGTGACA CATACACAGC TGTGATCGCG CGCCAGCCAC GCGGGCACTC TCTGCATTAG 600
GGCACGTGCC GCTGAATTTT ACCGAACAAA AACACGTTAA CGTGATTACC ACGGCCTTCA 660
GCAGCTCCTG CACCGGTTAA TGCCGTGTAC CGTCCAGAGG ACAGGTAAAC ACGAGTGAAG 720
CGCTGCCTAA ACACACAGAC AGCACTGAAC GCTGTAAACA TCACGACTGG AGATTACAGC 780
GTTACATAAA GACGCCATAT GGGATTTGAC ACGGGCTGCA GAGAATGTGT CCATATGTTA 840
CGCACACACA CATAGAGAGC CAACGATATT CAAAACAACA CAGCGACGCG ATTAACAACA 900
CACGGCAGAC TAAATCATCA CAACGCGATT CATTCAGTGC GACTCGCAGA GATCATATTC 960
AGCAGCACAA ATGCATATGT TCGAGGATTA ACATTTCAGT TATATCCTGA AAGAAGAGAG 1020
ACTTTAGAGT AACGGCTCAT CATAAAGTTC TCCTCTGCGG CTCGGTTCAG CTCCACGCGG 1080
GTTCATCTTT AAAACATGCA CACAAATCCT GATGCTGTGA CTGAAAGCAG CCGTTAACTG 1140
CCGTACCTTA TTCCGTCTAG AGGTGCTCAG AGAATCGTTC GGGACGCGGT CTCCGGTAAT 1200
AGAGCCTCCG ATAGCCTCAC AAAACGTAAA ATTGAAATTC CCACACCGAA ATCTTTCTGG 1260
GAGAAAAGCC AACGTAGTGA AACATGCGAA CCCCTCCCCT CGATGCTCGC GCTGAAACCC 1320
GCCCCGCGTC ACGATTGGCT GACGACTCTC GAACTCGGAA GGAGATTAGT GGAAGTGGAT 1380
GTCAGTCTGA AATACTCGTC TTCTATTGGT GAGCTCGGAG AGTGGTTTAT AATAAGGATG 1440
TTGACTACCG AACTGCGGAC AAAAGGAACC GCAGCGAAGA GTGTTGACTT TCAGAGAAAT 1500
AGCGCCCACT GGTGGATCAA ACTAGCAGGA CAGAGCAGAT TAAAGGGATA GTTCACACAA 1560
AGGTTTACTG TTTACGTACC CTCAAGTGGT TCCAAACTTG TACGAGTTTC TTTTTTCTGC 1620
TAAAGGATGC TAACTGGTCA TAATTGACTG GTTTTTAGAT GTTTGTTTGT CCTACTATGT 1680
AAGTCAGTGG TGACTGGTTT CTTTTTAATT TTGTTTTATT CTGTGACAAA TGAACGGTTA 1740
GTAAATGAGG ACATAATTTG CAGTTTTCCC TGCTAAAAAA TCCAGCTTAA ACCAGCCTAG 1800
GCTGGTTTAA GCTGGATTTT TCAACAGGGT TGAGTTAACT CTAAGGGTGC TTTCACACTT 1860
GGGACACGAT TGTCTGGTCC GAACCCAAGA TTGATTATAC CCCCTTGTGT TTACACCATC 1920
CAAACCCTGG TCAAAGTCTC ATTAAAGCAA GTAATTTCAC TCGGCGGCCA TCTTTGAAAC 1980
GCCTCTCTGG CAGTTTGCTT GGGCTGAATA GGGAAACATC AAATTTTCCA AAACTTTTTG 2040
CCAAGCTC 2048