EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-16327 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr2:57014546-57015478 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATF7MA0834.1chr2:57015059-57015073CAATGACGTCACAC+6.11
BHLHE23MA0817.1chr2:57015405-57015417CAGCATATGTTT-6.04
Creb5MA0840.1chr2:57015060-57015072AATGACGTCACA+6.11
Lhx3MA0135.1chr2:57015328-57015341TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr2:57015325-57015338AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr2:57015324-57015337AAATTAATTAATT+6.92
Lhx3MA0135.1chr2:57015329-57015342AATTAATTAATTT-6.92
POU6F1MA0628.1chr2:57015326-57015336ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr2:57015330-57015340ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr2:57015326-57015336ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr2:57015330-57015340ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
TTAATGAAAT TATCTATAAA TTAAGGAAAA CATGCACATA TGCGCTACAT TAGTTATATT 60
CAGAATAGCA CACACTGTTA TTATTATTTC AGCAGTACAT TTTATCTGAT GGTTTTGTAC 120
ATAAACGCCT GTGGTGTTAA AACACCACAA ACTGTCTCAT TATGAAAAAT AAAACTGATA 180
AACAATTTCC ATAACTCGGC GAGGTTTGTA ATTGTCCTGC AGAGTGTTCA GAGCACAGTC 240
ATTATAATGT AGGAGATGGA GTAATCCAGA AATCCTTTGT GTCTCCCTCA TAAAAGCACA 300
TCTTCGTTGT ACCACGAAAC AACTGAAGGC TATGCTAAAG GATGATGGAT AACATGAATA 360
AATGGTCTGT TGTCTTATAT CCACTGTTTA CCTTGCTCAC TGTCCGTATT GTGTGTCCGT 420
GTATTCATGA AAGTGACAGA ATAAAAAGAT ATACAGATGA TGAATGCTCG TGAACGCGAC 480
GACGCCCCCG AGCGGACGTC AGGAGGAGCG CGCCAATGAC GTCACACCTT CACAGCTGCC 540
GCAGATGCGG CGTTTCTGCG TGAAAAAAAG CCAAGGCGTG AAGCTGGAGT CCGTATAATC 600
ACTTTGAGCC TTTGCAAATG CAGTTAGAGA AGGAAACTGC CCAGATATAT CCACACAAAG 660
TGCTGCTCCT ACATTTCACG AGCTTCCAGT AAAACTCCAC ACAGAAACGC CAACTGACCC 720
AGCCGAGGCT CAAACCAGCG ACCTTCTCGC CATTAATATA CCATTGTTCA TATAATTCAA 780
ATTAATTAAT TAATTTTGCT TCGGCTTAGT CTCCTTATTC ATCAGGAGTC ACCACAGTGG 840
AATGAATCGC CAACTTATCC AGCATATGTT TTACACAGCA GATGCCCTTC CAACTGCAAC 900
CCAGTACTGG GAAACAGTAT ACTCACTCAT TC 932