EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-16043 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr2:44498555-44499582 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATF2MA1465.1chr2:44499506-44499520TGATGATGTCATCG-6.92
BATF3MA0835.1chr2:44499506-44499520TGATGATGTCATCG-6.31
BATF3MA0835.1chr2:44499506-44499520TGATGATGTCATCG+6.46
BHLHE41MA0636.1chr2:44499237-44499247GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr2:44499237-44499247GTCACGTGAC-6.02
JUNMA0488.1chr2:44499505-44499518ATGATGATGTCAT+7.52
JUND(var.2)MA0492.1chr2:44499504-44499519AATGATGATGTCATC+8.33
MITFMA0620.2chr2:44499233-44499251GTAGGTCACGTGACATCT+7.36
MITFMA0620.2chr2:44499233-44499251GTAGGTCACGTGACATCT-7.36
TP63MA0525.2chr2:44499218-44499236TACGTGTAGCAACATGTA-6.18
TP73MA0861.1chr2:44499218-44499236TACGTGTAGCAACATGTA-6.07
USF1MA0093.2chr2:44499236-44499247GGTCACGTGAC-6.14
USF2MA0526.2chr2:44499233-44499249GTAGGTCACGTGACAT+6.1
Enhancer Sequence
TTGACTTGCT GTTCAGAGAG AGAGCCCTGA GCTTATAAGA TCCTGGGTTC CCACCTGTTA 60
GCAGGGCGAG AGGGGAGTTT GAGCTCAGGT AGGTCTTGAT GAACTCCCCT GATTCATTTC 120
TGGCTAATGA CAGATATAGG GTTGGTTAAA GAGAGATATA CAGCTTACTA AGAGTTTGAA 180
TATGATGCCA ACTTGGTATG TTCAGTTTGC ATGTTTTTTG TATCATAGGA CGAAACCAGA 240
GAACCCGGGT GAAACCCACT GTTACAGTTA ATTAAGATGG AAACGCTAGG GTTAAAAGCA 300
ACATTTAAAA CTTATGACTC TTTATGAATG GTGGCGGCAA TGGAGCAGTC AAACAACCAA 360
ATTATGCCAA AATAAGTGTT TATTTTACAA AGTGGATAAA TGATAAACAA AGTATTTACA 420
AAAAAAAGAA AACAAAAATA AATGGTTGTA ATAAAGGGGA GGAACAAAAG TGGCGCCAAA 480
GAAAAGAAAA TAACAAAACT ACTAACTAGA ACCCACAATC TCTATATGAT CTAATAAAAG 540
AAAGAAAAAG AAAAGTCTTC AGTGTTTTCA CGCCCTATAT AAACTACACT TCTAAACGCA 600
AACCTAACTT ACAATTAGTG GCGCACACTT CTAAACTAGT GTGTATAATA CATTGGTATC 660
TCCTACGTGT AGCAACATGT AGGTCACGTG ACATCTACAC TATTCCTCGA ATCCCATGTC 720
GTATATCTGG TAATCAGAGA GAAAACACAA TTAGAACACT TTTAAAGATC GATTTTAGCA 780
CAAATGATTA TAACACACAA AGCACAAGAA ACTATCACAT AATCCAGCTA TCCAGCAAAC 840
CACAGTCAAC CAACATAGCA AACACACAAC AGTGAGCATG CAAAAAGCAA GCTAGCTTTC 900
GACTGCACCG GCTTCCTTTT AAAGTGGGGA AGTCTTCTTG TGATTGGCCA ATGATGATGT 960
CATCGCAAAC GGTAATGATG ACTGGCATCT TGCTTAGCCA ATAGGTAGAT GAGCTGGGCG 1020
GACCTAA 1027