EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-15983 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr2:42439209-42441150 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MNX1MA0707.1chr2:42440860-42440870GGTAATTAAA+6.02
NFAT5MA0606.1chr2:42440422-42440432AATGGAAAAT-6.02
NFAT5MA0606.1chr2:42440501-42440511AATGGAAAAT-6.02
NFAT5MA0606.1chr2:42440581-42440591AATGGAAAAT-6.02
NFATC1MA0624.1chr2:42440422-42440432AATGGAAAAT-6.02
NFATC1MA0624.1chr2:42440501-42440511AATGGAAAAT-6.02
NFATC1MA0624.1chr2:42440581-42440591AATGGAAAAT-6.02
NFATC3MA0625.1chr2:42440422-42440432AATGGAAAAT-6.02
NFATC3MA0625.1chr2:42440501-42440511AATGGAAAAT-6.02
NFATC3MA0625.1chr2:42440581-42440591AATGGAAAAT-6.02
PHOX2AMA0713.1chr2:42441052-42441063TAATTGAATTA-6.14
Phox2bMA0681.1chr2:42441052-42441063TAATTGAATTA-6.14
RARA(var.2)MA0730.1chr2:42439847-42439864GGGTCACTGAGAGGTCA+7.12
Rarb(var.2)MA0858.1chr2:42439847-42439864GGGTCACTGAGAGGTCA+6.87
Enhancer Sequence
TGAGAGCACA TCCTCTTTCT AAGGCTTCTC AAGCATTTGC AGCTAAATTC GCAGCTAGAT 60
GGATTGGGCC TTATCGAATT GTGGAAAAGC TTGGTCCGGT GAACTACCGG ATTGTTCGGG 120
AGGATAATGG GGAAGATTTA CGTACAGTTC ATGTATGCAA TTTAAAACCT GCATTCCCCT 180
CCGCAGGGGA ATTAGATCGT AGAGAGAGAG AAAGGGTCCT GAAAATTTTT GTCGAAGAGT 240
CAGAAGATGA GGAATTTCTC GGATTTGAAT AGTCCTGAGA TCCAGTAATC ACTTAACTGA 300
TTTCCATATT TATAGATCAG ATTATTTGGT GAGTAGAGTT ATTGGTATGG AAAGCTGTTG 360
AGTGTCTTTT TATTGCTGCA TAATTTTTAG GTCTTAAAAA ACCCCTAAAG ATTTCTTGTA 420
AGTAACTTAT AGATCACAAC CTCTTTAAGT TTGACTGATC TTTTTCCATG GGGGGGAGAG 480
TGTGACGATC GTCATTAGAA TTTTCCTTAT TATTGTATGA GTGACGTCTG ATTGGGTTAC 540
TGCTGTCAGC TGATGCAACA TTATTTAGAG CGCCTTGGAT GGGTTTCTCG CTCTCTCTCA 600
TTCATTCCTT ATCACGCAGT CAGCATGCAG GTGATTCCGG GTCACTGAGA GGTCATGCTG 660
ACGGAGTGTG TGTGTGTTGA GAGCGCACTG CGTACTTGTT GCTTTGAGTC CGTTTTTTGT 720
AGCTCAATAT GTGTTTTCGT GCTGCGTGGT CTTGCTCTGA GGTAGTGGCA GTGTTCTTTG 780
AAGTTGGTCA CGGCATCGAA AGTGCGAGTA TGTTTTTGAT GCGGACGTTG AAGCGGCAAC 840
ATTTATGAAT GGAAGAGTTT ATGATTTTGG CGGAGGTTGT ATTTGCGATG CATGGTGAAC 900
GTATTATGCG CTCGGGTTTG TTTGTGGAGT GAGGCGCGGG TTTATTTTGT TTTTTGGCGC 960
TCGAGTTGCC TATTTGTTTT GGGTTTTTTC TTTCTTTTTG TTTGAATGTT TGATCACTAT 1020
CGTGATCGGG ATTTGTGTTG CTGTTTTCTG GGCCCAGTAG CATCGACGGG TGATCGGGTA 1080
AGCAAATGTT TCTTCTTTGA TTTATATTGT TTTGGTTAAC TTGTATATGT GTATGTATGT 1140
CCAAAAGATT TAATGAGATG GTAGAGTAAC CATATGAATG TGCATTGCGT TCACGATTGC 1200
TTCAACGTGC ACAAATGGAA AATCTACTTT AGCGTATACG AATTGAGAGA CATTTCAAGT 1260
GCATTGATTA CCCGTTTACT TCAGCGTGCA CAAATGGAAA ATCTACTTTA GCGTTTACGA 1320
ACTGAGAGAC ATTTCAGAGT GCATTAATTA CCCGATTACT TCAGCGTGCA CAAATGGAAA 1380
ATCTACTTTA GCGTATACGA ACTAAGAGAC ATTTCAAGTG CATTGAATGT GCAATTGATT 1440
CAGCGTGCAC AAATGGAATA TCTACTATGT GTAAAGTGTA CAACTGAGTT CTATAAGTTC 1500
TTGAATGTGT GATTGATTTG ATTTGAACTT AAAATATTAT GTTTGTGGGA ATTTGATTAA 1560
TATTGGTTGT TGTATATTTA GAAGTGGTTT ATTTGATTTA TTTCTTTATG GTTGGTTGAT 1620
GTATCACCCG TTGATGGTTT TGTTTGTAAA AGGTAATTAA AAGGTATTGT GCCTGGGCCT 1680
GGAAATTTAA GTTTGTTTGG TTTATAGATT TACTTACAAT GTGTTGAAGT TAAAGTTTGT 1740
TCTTTTTGTT TTCTTCTTTA TTAATTCATT GATCTGTTGC ATGATTGAAT ATCTGATTTG 1800
GTTTTTATTA AATCATGCAT CTGTTGAAAC TTAAATTTTC ATTTAATTGA ATTATTTAAG 1860
AAACTGTAGT GGGGTCTTTC AACCCCTGGC GCCCAACCCA CTTTATTAGC CAAATACCGC 1920
TACATAATTA TGTTCTAGTT A 1941