EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-15934 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr2:40451662-40454051 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr2:40452997-40453018GTTTGCTTTCCCTTTTCTTTC+6.16
TFECMA0871.2chr2:40453871-40453882CCCACGTGACC+6.62
USF2MA0526.2chr2:40453869-40453885TGCCCACGTGACCAAA-6.07
Enhancer Sequence
TGCAGAGCCT TCACATCCTC GGTTTTAATT GGAGACCATA AAAGGGCTTT GTCCATATAA 60
GCAGAGGCCA CTTTCTGTTC GTCCCCAAAC TGTTCCTTCA ACAAAGTTTT TGCTTTCAAA 120
TATCCTCGAT CTGGATTCAT ATAATGACAG CTCCCCACAA GTGCTTTAGC ATGGCCCCTT 180
GTATATTGCT CCAAGAAATA CAAACGGTCA CAGTTGTCAT TTATATTTTT CTCAATACCA 240
TTCTCAAAAG CTCTAATAAA AGAGTGGTAT TTCAGTGGGT CACCATCAAA TATGGGCATT 300
TCTCTTTTTG GTAAAGCTGA AAGCCCCTGT TGCTGCATCA ACAGTGTTGT TACCTCATTC 360
TGTTTCTTCA TGAGACCAAG AACACAATTT TTGGTTTCCG AATCCATGAA AATATCTGTA 420
TTGAAATCAT GTGGTCCTTG TGAATCTTGC ATGTCGAAAG AATTCAGGTG GTTTTGCGAA 480
AATGGTGGGT CAATGATGTT TGATGGAGTT ATATTGTCCA ACACTGGAGT AAGCTTGACT 540
TTGGGTTTAG CTCCTAAATA TCTCTCCTTA TTTGAATCTG ATGGAATAAA TTCACCTGCA 600
TCAACATTGA GTGGTTGTTT AGACTGTTTT GCCACATAAG AGTTCATCCC ATCTGAAACA 660
TTTGATGTCA GTATCACGCT TGTTGTTGTA CTGTGTGTTT TGAGAACCTC AAGTTTTGCC 720
TGTTCTCCTG CAATTTCAGC ATCCAGTTGC AATCTTTCTT TCCTTTTACG CAACTTTTCC 780
TCCTCTTCTT CCAGTGCATG TCTTTCTTCT AATAATTTTT TCTTCATGGC TAAAGCAGCC 840
AACTCAGCTT GGGCTTTTAA ACGTGCAGAT GAGGTTGAAG AATGTTTTGA CAGTGATGAT 900
TTGTTACAGC TTATGTTTGA GACACTATCA CGTGGATTAA TTTCATCCTC ATTTTCAACT 960
TCATTTGATT TTGCAGAAAT CACATTTTCG TTCATTTCTG TTGCATTCTG TGAAACACCC 1020
TGGGTTTGCT CAGTTTCACT GATCCATTGC TCAGTTTGGT TTTGAAACAC ACTGCTGTAA 1080
TTCATTATGC TTAAAAACCA TTCCTTTTGT TTAAGAAATT CGTCCTCAGG AAGTAATGGC 1140
ATAAGTTCAT CATGTGCATT AACAGCACTC TCACACATTG TGTTTAAAGT CATTAAACAT 1200
TGCTTTATTT GAAGGATGTT TGCCTTTTGT TTCATATATT CTTTCATTTT TGGTATCAAC 1260
CCTTTGATTT TATCAACAGC ACGTTTACGT TCACATTGCA TCTCTCAATT TTATTCAGCA 1320
AGGCCTTTTG AGTGAGTTTG CTTTCCCTTT TCTTTCCCAT CTCTTCAAGC GAGCACGGGG 1380
TACCACCAGT TTGACTCATA GTGACTCTTT TGATTCAGTG TTCAGTGAAT CACAACATCC 1440
AAACACAATG CAACGTTTGA ACACGCTCAA ACGATTCGAT TCAATTCAAC AGCAGTTCAT 1500
TTTCCTTTTA AACAACATCA CGGCATCACA CAAACAAGCA GCAAAGTGCA GACTTCCTAC 1560
AGACACCAAA GTAAGTCGCG CGACCTCGCG CATCCGATTT GCATTCCAAA CAACTTTAAC 1620
ATGCACCAAT GCCAACCAGA TTCCTCATCC ACACATATAT CCACAGATAA ACTTATCTGT 1680
CCTATGAAAA CGAACACATG ACGTGGCCCA TTTGGTTTGC AATCGCATCA CTTACTTGGC 1740
GTCTTCCTGA TTCGTCTTTG CGCTGATTTT GCGAGCGATG ATTTTCCTGA TAAGATGCCG 1800
TTTTTTGTTG ACAAAATATT GCGACTTCCT GATGCCTCCT ATAAGTCGCT CGAGAGGCAG 1860
TGAGGGTCCT TTATATTTGT GACGCGCTGG TGGCTTTAGA CAGAGACACT GAGCCCAAGA 1920
TGTGGAAAAC TTTATATAAC TTGAAGCATG AAAAAACAAT ACAGCAATTT GTGTCTTTGA 1980
ATACCTTGTA TGGTGCCGAT TATTGCGTTG GTGTGATGAT TGTTGCGTGT GCCGTTGTGA 2040
TACAGTTTTG CGTTGCTTGG TTTGCGCTGC TGTTTGCGTT GCTGTTTGCG TGGCTGTTTT 2100
GCGTGGCTGT TTTGCGGTCA ACAAAAAATA CGGCTACCCC ACTCTCCTTC TCTCCTCATC 2160
ACCTGTGTGA TTGTGCACGC GCTTTATGTT CGAGCAGGTG CCAATTATGC CCACGTGACC 2220
AAAACATAAA ACGTCACTGT GAAACCCAAA CCAATCAGTA TCAAATAAAC ATTATAATTA 2280
AATGAAAAGT AATATGGCTC CTATAACTGG GATTACTGAT GGCTCTGCGC TGCAGGTCGC 2340
ACACCGATGT GCAATCATAA AAAAAGGCCT TTGAGGGCCT CTTAATTTC 2389