EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-15807 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr2:33973384-33974745 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx4MA0853.1chr2:33973664-33973681CGTTGTTAATTAACGGG-6.26
CTCFMA0139.1chr2:33974112-33974131TTACCAGTAGATGGCAGTC+6.82
Rhox11MA0629.1chr2:33974054-33974071ATTACGCTGTAATGAAT+6.2
Sox3MA0514.1chr2:33973834-33973844AAAACAAAGG-6.02
Enhancer Sequence
TAGCTAGGAA ATGACCAGCT GAACCCAGCT AAAGCCAGCC AACCAGCCTA GACTGGTTTA 60
AGCTGTTTGT TTCCGCAGGG TTCTCATTCT GTTTTGAAGA TTGATTCGTT TATGAATCTG 120
GTTCTCAGTT TAGCTCGACT ACGACGCTGT TCTACAACTA ACATACTGTT AATAATCAGT 180
TAATTGATAA AACTGTTCGT CACAAATCTT ATCATTTTAG TTAGGAATAG GAAGTACGAT 240
ACCTAACGTT AGGCCTATCT CCGTCTCCTT AGTCTCCTGA CGTTGTTAAT TAACGGGTTT 300
GAAAGATATA TTTGGGTGAG TCAATTTAAA CGAAACATTT GTTGTAGGTT AAGCTATAAA 360
AACAGAATAA CGTTACACAT TAACCTAATA TTTGTAGGAA TTAAACTAGA AACTACATTT 420
CTTTTAATCT TTGGCATCAT TTTTCATCTT AAAACAAAGG CCTAACGTTA TCTGTGAAAC 480
TGTCAGTTAA CGATAAACAT GCTAACACTA GTATGATTAT GTTAATGCTA GTGTTTTTAA 540
TAGTCTTATA AAGTACGTTA TATATCTTTA TCTGCTTAAA AACTAGTTAA AACTACTTAA 600
TTTTTGTATA GGATTTTTCA AGAAACGTGG TTTCTTCTGA AAAAAAATTT GCTAAATTAT 660
TTATTGCTAA ATTACGCTGT AATGAATGCT AATATTTGTT ATCATAGGCC ATGCGGCACG 720
ACATGTTGTT ACCAGTAGAT GGCAGTCAAA ATATGCACAC AAACATTTTA AATGCACTTA 780
CAACTGCTGC ATTGGAAATA ACATTTTCTG CTGTTGTATT AGAGTTCATT GCGCCTTTAT 840
TTATTAGCTT TAGCATGTTT ACCTATTTAA ATCCACGTAA CGCACTAGGG AATTCCCAGA 900
ATCTTATTTG GCCCTGATGT CTCAGAATAG TTTTGCCACA CTGAAGCTTG CTTATTTTTC 960
ATGCAGTTTG GCATTGCCTG GCAAAGCTCA TTGGCACCAG CTCCAGGTGT CTAAATTTAA 1020
TGTATTCACA GAGGTGTTTT AATATTTGAT TTTGTGCGTG AATGCTTCAG TGTTGTCAAG 1080
GAATTGTTGA ATGTTCTTAA TGCTAATTTA GATTGCTTGC TATGTCTTTT GATATACTTT 1140
TTTGCCTTTC TTTTCCAGGT GGAATGTCTA AATGCACATG TCTGTGGTGT TCTGTGTGAA 1200
AAGATACAGG CGCTGGCGGC AGGTCTGTCT GCAGGGCTGT GGTGAGTCTG GGTTTCCCCA 1260
GCTGAATATG CTTGTTTATG CTTCCATTTC AAGGTGGCTA GAGGAGAGCG TGCCCGTCAA 1320
CTCAGGTGTG CAAACCACAA AGTCTAACAA AGAGGATTTA T 1361