EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-15062 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr2:5975402-5976564 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GRHL2MA1105.1chr2:5975409-5975424AATAACTGGTTTGTA-6.08
HNF1AMA0046.2chr2:5975562-5975577TGCTAATGATTAATA-6.01
HNF1BMA0153.2chr2:5975563-5975576GCTAATGATTAAT+6.22
ONECUT1MA0679.1chr2:5975472-5975486AATAAATCAATAAT+6.36
ONECUT2MA0756.1chr2:5975472-5975486AATAAATCAATAAT+6.53
ONECUT3MA0757.1chr2:5975472-5975486AATAAATCAATAAT+6.82
POU4F1MA0790.1chr2:5975569-5975583GATTAATAATTCAT-6.36
POU4F3MA0791.1chr2:5975567-5975583ATGATTAATAATTCAT-6.6
ZNF263MA0528.1chr2:5976312-5976333AGTGGAGGAGTAGGAGGAGGG+7.23
Enhancer Sequence
CAGCTCAAAT AACTGGTTTG TAAGTTTAGC AGTGAAAAGT TCAACACAAA CATTAAGCAC 60
ATTGTGTGTT AATAAATCAA TAATACAGCA CTTATAGCTG TATAAACCGT TTAGTCATGT 120
ATTAATGAGT TAATGCTCAT CAAATGATGA ACTAACTATT TGCTAATGAT TAATAATTCA 180
TCGTGTGCAG TTCAGTTATT AAAAAATGTT ACCTTTCCTT TTTGAAATTC TACTGATGAA 240
CACTTCCGGA AGCAGGGTCG CTGAATAAGT AATAAGGGGG CGGGCACTGA TGCACTATTA 300
TTAAAATGTA GCCTATGAGA GGCCGCCTTC AGGACCAGTG ACTCCGCTAA CCGGATGGGG 360
GTCTGCAACT GTACGGTGTG GGATGCTTCA TTATCATCAC ACACACATGC ACAAATCAAT 420
ACTGTGACCG AATGGCATTA AATGTCACGG GGTGCAAATG CGTTTCATTT CGTCCGTTAA 480
ACCAACACGG ATTGTAAATC ACTATCAGTT GTATTCATCA TATATAGTGG CAACCCGTGC 540
GCTCTTCAGA TCACCTCCGC ACTTCAGCGC GGTTTATACC GTTTTTTTTT GTCAGCACAA 600
TGAAAGTTAC AGTGGATTTT GAGGAATGCC TGAAAGATTC GCCACGTTTC CGGTGAGTCT 660
GACGTTAATA TCAGTTCATA TGCTGGTTAA TGATGTACAA AAGCGGATGG ACGGGCTGCG 720
CCTCAGAGCT GGGGGTCTGC ATGGTGCCCA CCTACAGCAC AGCACTGCAG GTACAGGCGG 780
ATTAAACATA CGATAAAATG TCCGCTTAAT CAAGATATGC CATCACAAAT GTTTTTACAA 840
GCCGTGGTCT ATCACACCTC ACCCATTTTC ATTTTGGTAA CTCCATCAAA TGACAGTAGG 900
CTATTCATAC AGTGGAGGAG TAGGAGGAGG GCGCCGCGTT TGTCCCATTC ACCAACATGA 960
AAACGCTCGA TTTCCTCATG ATACACCAAT ATCTAAACTG TTTTTATCAC GGAGACGGGT 1020
TTTAAAATCT TTTTTCCTAG TCTATAGTGC GTTTTGATGT TGCAGACATT CGTTTGGCGT 1080
GTCTGAAAGA TGTTATATAA TGGCCTTCAA ATGTTTATGA TGTAGATTAT GCGTTAGTCA 1140
AACCAGAAAA TATTATATAG AC 1162