EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-14948 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr2:1586829-1588216 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr2:1588123-1588140TTCAATTAATTAATTCG-6.19
Hmx2MA0897.1chr2:1588140-1588157AAAAACAATTAAAAAAT+7.26
Hmx3MA0898.1chr2:1588140-1588157AAAAACAATTAAAAAAT+6.95
Lhx3MA0135.1chr2:1588126-1588139AATTAATTAATTC-6.29
POU6F1MA0628.1chr2:1588127-1588137ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr2:1588127-1588137ATTAATTAAT-6.02
ZNF384MA1125.1chr2:1587232-1587244AAAAAAAAAAAA+6.22
Enhancer Sequence
AGTGTGACTG CTGAGAGCAA CAGATTCTGG AACTAGGGAC ACCGGCCCTC GCGGCCAAAA 60
AACGGACCGG CCCACCGGGA ATTCTCCCGG TCCTCCCGAT TAGCCAATCC GAGCCTTACT 120
TGTTCGATTG GGAAGTAATA AAACAGAAAT CAAGCATTTT TACAACTATA AAATGTACAA 180
TTGTATAAAG TTCCTGAAGA TCCAATTAAC GGAGCGTCCT TAAAAACTTC TGTCCCAGGT 240
GTGCAACAAT GCAACCGTAA TAACTTCCGA CAAACAACCT GCCCTTAAAC ACACTTCAGC 300
AGATGAGAGG AATAAAGGCA GCCATAAGCA CGCGGCATTC TTTTATCAGC ATGTTTTTTA 360
AGACACAACA CCGGGGCTTA ATGAAAGTCT TAAACACCTT CAGAAAAAAA AAAAACTTTG 420
CTGGATTTCC ATGCATATAT ATTGCCTCAT TCGTACAGGG GGGGAAAACA GCCCGTCTCG 480
TCCCATTTCT GTGTAATTAT CACCCTTCAG GTGGAGCAGA TGGCAAATTA ACTGCGGGAT 540
GCAAACTGCT GACAATGTTG TCGTCTTATC CATTTTGCAT GATGACAGTG TTAGTGTTTT 600
ATGCACATCC TGATTACAAC AATTTTGACG GCGGGGGGTT GCTGTCAGCG ACTCCAGAAG 660
AATGAAATCA GATGAGCGTC TGGGTAAGTT GCGGTTTTAG CCTGTGATAT AATCATCAAA 720
TGTGCTGTTT GCATTTGAAA AACAGGTTCA TTAGGATCAC TTTTTAGGCA GTGCACAAGC 780
ATTGGTGGTT ATTTGGAGAG ATAGAAAGAG ACTCTGATTT AACTTACCTG AAAAGTTCAA 840
CACAGACTCA TTGTGAATTT GTACCCCCGT ATACATTTCT GGAGAGCATC AATTATGTAG 900
CTAGAGGAAC GTATGGCTGT ATATTGTCTT TCAAATGAGC ACTGAGTGGG GGAGGTTTGA 960
CGCTGCTGAT GGCTTCTGTT TCTTTTCGCG CTAGCAGCTG ACTATTTACC TCCATGTGCA 1020
CGGCTTTTCC ACTGTTACCA GTTTGCCCAG TAGCTCACCA CGTACGTCGG CAGACTTGAG 1080
ATGCAAAGAG GAGTTGATGG GTACGATGGG GCGAAGAACG CTTGCAGAAA GACTCTGAGC 1140
TCCAGTGTCA GGGTCAATAT GGATGAAGTT AATATGGAGA CAGATCAGTC TCAACAATAA 1200
TACATTTGCA AAATATAATT CATACATCCA CAATGGAATT AACATTTGCA AAATCCTATT 1260
CGTTTATTCA AGGCGATAAT CAAAAATATA CAAATTCAAT TAATTAATTC GAAAAACAAT 1320
TAAAAAATAC ACAAATCCAA TTCAATAATT CAAAACACTA TTCATAAATA CACAAATCCA 1380
ATGTGAT 1387