EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-14722 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr19:41557881-41558808 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArntlMA0603.1chr19:41558088-41558098GGTCACGTGC+6.02
FOXE1MA1487.1chr19:41558393-41558408GTTGTTTGTTTTGCC-6.13
Foxa2MA0047.2chr19:41558076-41558088TGTTTACATTGT+6.04
IRF4MA1419.1chr19:41557955-41557970TGGTTTCGGTTTTGG-6.78
IRF5MA1420.1chr19:41557956-41557970GGTTTCGGTTTTGG-6.2
IRF9MA0653.1chr19:41557956-41557971GGTTTCGGTTTTGGT-6.66
POU4F1MA0790.1chr19:41558773-41558787CTGAATAATTAATC+6.28
POU4F2MA0683.1chr19:41558773-41558789CTGAATAATTAATCAT+6.26
POU4F3MA0791.1chr19:41558773-41558789CTGAATAATTAATCAT+6.43
Enhancer Sequence
TGCGCTCTTG TACTCGTGTT TGTGTTTTCG TCTGTCAGCA GCGTGGTGTT TCATTCCCAG 60
CGTCTCAGTC TTGTTGGTTT CGGTTTTGGT CGGCGCTGGG ATGAAGCATG CACGCTGCGT 120
GTGTGAGCTC ACGGTGATTG CTTTCATTCA TCGGGTGCTC GTGTCTTGCG TCTTTTGTCA 180
AAGCACGTGG CTCGGTGTTT ACATTGTGGT CACGTGCTTT TGTCGTGTGC TTCAGTGTTG 240
TGTTATGTGA GCGCATGGCT TGTATTGTCT CTCTGTGTCA TGCGCTCTCC CGTCTATTGT 300
CTAGTCCCAC CCTCCTTGTC AACCCATTAT TAGTTAATTG TGTTCACCTG TGTGTCAATT 360
TACTTTTTGC TTTATAATCC CCCTCATGTT TTCAGTCCTT TGTCAGTTCG TCGTCGAAAG 420
TTTCCTGTCC TGTTGTGTCC AGCCCTGTCT TGTCCAGTCA GTCAAGTTTG TTTGTTCTTT 480
TATTTGTTTC ATTAGAGTTT TACCCCCTCG GGGTTGTTTG TTTTGCCTTT TTGTTTTCAT 540
TTTATTATTA ATAAAAAACC CATTATTGCT GCATCTGAGT CCTCGCTCCT TTTTCCCCTC 600
ACCGAACGTG ACAGCGTTCA TCTTACAGAT CCTATTGCGA TAGCACCCTC CCAATGAATA 660
TTGGACAAGA AGAAATGACC AAGCATCCAG CCCCAAATAT ACAATCTCAT TGAAGTGTTT 720
TTACAAGAGA GAAGTTAAAG GCCTACAAGT CTTTGGATGC CAACAATGTT GTTCTGTGTG 780
GTCATGTGCC AGAAATAATG TTCCACGACT ACCAGATTCA ACACTATGTA GTGCTAAAAA 840
CCGAGGTTCT GCCCAGCCAA AGACAAGGAA AGAAGACGGA GCTGTACAAG GCCTGAATAA 900
TTAATCATCA ACTAGCAAAA CGACTGC 927