EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-14462 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr19:29057731-29058785 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CrxMA0467.1chr19:29058743-29058754AAGAGGATTAG+6.62
Foxa2MA0047.2chr19:29058699-29058711GCAAAGTAAACA-6.27
PBX3MA1114.1chr19:29058464-29058481GAGTGAGTGACAGGCAA+7.61
SNAI2MA0745.2chr19:29057909-29057919AACAGGTGCA+6.02
Enhancer Sequence
TCGCTTCGAA CCTCATACAC CACAACTTTG AAAGCGGTCC AAATAAAGTC ATAATACTCG 60
GGTAGTGTGT CATGTAGTGA TGTTTAGGAA TTAGATTCCT TTCAGGATAA AGAATCTTGA 120
ACTGTGTATG GTGATCAATT ATTAGCTGCT TAAGATGGAC AGCAAGCCCT TTTGACACAA 180
CAGGTGCAAA AATTATGTCA CAAATTTCCC TCAACATTAG GAAAAGGTGC CAGTGTGGGC 240
TCTGTGTGTC AATTAAATCA CCTAACAGAA AAGGCAAGAC TAGTAGTAAA CACCACATCT 300
GTGATGCAGT CTGCTTAATA GCGTTTTCAG ATGTCCTCAG ATTGACAATA ACACTAGGTT 360
TATTTTTTTG ATTTCCATAG CCATAGTCAA AAGCTGCTAT TCTTTCATTT AAAAGTTCCA 420
GAGAAAAACA TTTCTCTTCA TAAATGAAAT GCCGCAGCAT CAATTTGACC TCAAGAGGTC 480
CGACTCCTTC CAACACATCA TGCATAATGT CTACACCAAT ATTCTCAGTG ACATGAAAAT 540
ACTGTAGGCT GTTTAGGAAT GAGTTATGTT TGACACCGGT TGCACTTGCA TCATTGAGTT 600
GTACATGGTA TGCATAGTTT TCCCTTGTAC GTCTCTCTGT ATTATTTTCA TCAAAAATAA 660
TCTGGGAACT TGATTTGTCA ATTAGACAAA ATTGACAAAA TCGGTTTGCA GAGAAACTTT 720
CCACATAGCC ACAGAGTGAG TGACAGGCAA GATTGTCCGC TGTCAGCAAA CAGACTGTTC 780
CAAAAAGTAA TTGATGTTTA TCGTGTAGTT TGACCTCTAT ACCATTCTGC TCAATTTCTT 840
TTAAGTCTGT TATAAGAGGT TCCAAAATTT TGTCAAAACC ATAAATGTCT TTATCAATAG 900
AATTAAATAA GAGACATAAA TGGATATTGG AAAGTACAGA ATTTTTTTCT GACGGCACAT 960
TTCGTAAAGC AAAGTAAACA GCCCCCATTT TATGAATCTT TGTTTTAGAT CCAAGAGGAT 1020
TAGTTGTTTC CAAATCATCG AAGTATAACT GAAT 1054