EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-14460 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr19:28879563-28880627 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr19:28880369-28880385CAATGTTTACTTAAGT-6.1
FOXC1MA0032.2chr19:28880371-28880382ATGTTTACTTA-6.02
FOXC2MA0846.1chr19:28880370-28880382AATGTTTACTTA-6.22
FOXD2MA0847.2chr19:28880371-28880384ATGTTTACTTAAG-7.22
Foxd3MA0041.1chr19:28880434-28880446GTATGTTTATTT+6.11
Enhancer Sequence
ACAGTTCAAT ACGTGCTTGT GAATTGCGGT TTTCTCGCTT TTGCGTTTAA TCAATTTATG 60
TGTGTTTTAT ATCTCCCCAA ATTGACTGTG TGTGTCTGTA AGTCCATAAA CTGAGATGAG 120
GAAACTCCTC CCCATGAGTA AATATCCAAT CACTATGCTC TAAAGTTAGG GGGTGCTTGA 180
CATTGCACTG AAAGGCATGC ACAACTCTCA CCGTGAGATG TTTTCTACTG CGAGCGTCTG 240
GACAGAGGCA AGCGCGTTGA TCCACTTGTG CGCGCATATT GTCATTCTTA CATTAGAAAT 300
AACAAACTTG CAAGCTCAAG ACGTGATCTG GGAACGGCCG CTGCTATAGT TATTCCAGTG 360
TGCGTGCGTA TTAGCCTTGG TGCACATACT TGGATCTTTA AACTAATGCA CAGTTAGCAA 420
CTTGTCATAA CTTTTCCGTG CAACAGAAAT GCAGCTTAGA GAAGCCTTTA GGATTAATTA 480
ACTGTGACGA ATTAAAGTGC AGTTAATAGT GAAATCAGCT AATCGTTGCA TTCCTATTAA 540
TGAATACGGA GCATAAAAGG CATTTTCTAC AAAACATATC CAAATTATTT TGGCTGCCCG 600
CACCACTCGC TTATAGTGAC ACGCTCTGCG CAGCCTCTGC AGCTCATACT CAACTGAACA 660
GACGACCGTC ACTTCATATA GCTATAGTGG CGTTTTTAGA CTGAACTAAA TTTATTTTTA 720
TGTCTTGGTC ACACTATTTG GGGGGCAAGA ACAAATTGCC TCGGGGGTCG GGTTCGGCCC 780
ATGGGCCGAA AATTGAATTT TTTTAACAAT GTTTACTTAA GTACAAATAT GTTTATTTGA 840
AATGGCCAAT TTATCTTTAT TAACTTCACA TGTATGTTTA TTTTCAAGAT TTTATTTGTT 900
CCCCAGTTTG TACATGGGCT ACCAGCAGCT GTGAGATTTC AGTGTTAATT TTTTTTTGTA 960
TACAATACAC TAGGAACTAG TGTACTTTTC TTGGCTTTTA AAGTAAAACA AAATGAGTAT 1020
TGTAATAAAT CGTTTTTATT TTTTTTTCTT CTAACCTCTT ACTG 1064