EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-14456 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr19:28789505-28790536 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr19:28790033-28790043GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr19:28790064-28790074GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr19:28790033-28790043GTCACGTGAC-6.02
BHLHE41MA0636.1chr19:28790064-28790074GTCACGTGAC-6.02
Foxq1MA0040.1chr19:28789574-28789585AATAAACAATT-6.02
MITFMA0620.2chr19:28790029-28790047TTTAGTCACGTGACTAGG+6.5
MITFMA0620.2chr19:28790029-28790047TTTAGTCACGTGACTAGG-6.5
MITFMA0620.2chr19:28790060-28790078TTTAGTCACGTGACTTGG+6.84
MITFMA0620.2chr19:28790060-28790078TTTAGTCACGTGACTTGG-6.84
USF2MA0526.2chr19:28790062-28790078TAGTCACGTGACTTGG-6.01
USF2MA0526.2chr19:28790031-28790047TAGTCACGTGACTAGG-6
Enhancer Sequence
AATGCTTTAA TACCAGTTGG TAATGCTTTG CTCTTGTATC GTTTTGTTTC AACATTGGTC 60
TGATATCCGA ATAAACAATT TGTGAATAAA TATGTCTTGT TTTTGTCTTA AAACAGGGTT 120
GTTGCTAGAT CAAAAACGGT GGCCTGAAGT TATCAAGAAT TATTTATATT ATTCATTAAA 180
TTTCCCATTT ATTGTATTTT ATTAATGTCT ACCCAAACCC TAAACCCAAC CATACTGTAA 240
AAATATTTAT TATTGTTTTA CAGTGTTACA AAAATGATGC TAAATTGATG GCGTAACTGT 300
AGCTGTATCC TATTTAGGCT ACACAAAACA GAAACATGAT TAAAATACAT AAAACCATGA 360
TTTCGAAGTC GGGATTCGAA CCCAAAACAT CATGCTAAGC ATCAATAAGC AAACCCACAG 420
TGCTCTAAGC CATTTGAGAC AGAGATAATT TGGAGACCTT GGCAGTCAAA TTAGGATTCA 480
CCAGGTCTCG AAACGTTTCT AAGCTGATCG ATGCTTTGAA TCGCTTTAGT CACGTGACTA 540
GGTGTTTCAA AACACTTTAG TCACGTGACT TGGTTGCTTC GGATCATGCT TCGGTGCAGT 600
GATTCGAAAC ACTTGCGCTT CGGGATCTCG ACACTGTGTC AAAACATCAG TTTCACGCCA 660
GCAATCCCTA GTTAAGAGCA GGCCAACGAC GTTTCTGCTA AATCATAGGT ATGTATGTCG 720
CTTTTTGTTG TCATCTAACG TTATATTATT TGATATGTTG GCTTTGATGT GCGCGTGTAT 780
CCTAATACGG AACTATTTGT TATAATTTAG CCGTGAGTTA CTTGTTTCGT GCACTTGGTT 840
TTGGCTATTT ACATCAATAA AAGTTTAGAG TGAATGTATT TGAAACAAAT AGCGATTTCA 900
ATCGAGTCAT TTGCTTTAAT AACTCACGAT TAATACAATG AGTATCATAT AACATACCAG 960
ATCAGGTATC CAAGTCAAAT ATAACATTAT GTCCTGTTTA TCTAGATTGC TGTCAGCATT 1020
GCGCACATCA T 1031