EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-14425 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr19:27201031-27202353 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr19:27201748-27201769ACTTACTTTCAGTTTTTTTTT+8.11
MafbMA0117.2chr19:27201891-27201903AGTCAGCAGTTT-6.22
NEUROD1MA1109.1chr19:27201981-27201994CTGCCATCTGTTC-7.04
SPDEFMA0686.1chr19:27201335-27201346ACCCGGATGTA+6.62
ZNF384MA1125.1chr19:27201760-27201772TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr19:27201761-27201773TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr19:27201472-27201484ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr19:27201473-27201485TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr19:27201762-27201774TTTTTTTTTTTA-6.37
ZNF384MA1125.1chr19:27201471-27201483AATAAAAAAAAA+6.62
Enhancer Sequence
GGTATATTTA ACTACACAGA GGATTTTAGT CATCACATGT ACTGTAAAGA TCTTAATTAT 60
TACAGAAACA TGTTGAGTGA ATGACGGTTT AGAAAATGAC AGTTTAATGA ATAGTTATTT 120
CGAGTTAGCT TTAGAGAAAA AGTGACAGAT ATTAAGAAAC TGCATTAGTT TTTTTACTGT 180
TTGTGTCTTG CACACACACA AATATCTTCA GAAATCGTGT GTAATTTTAT GGAGCCTATA 240
TTGTTTTCAA TGTTACCATG TTTTACCTGA AATAAGAGCT GTAATTGTAC GTAATGTTTT 300
TCTTACCCGG ATGTAAAGTT TGAAGACCCA CAATTAACAA AAGCACTTGG GTATCTAAAG 360
ACCAAGAAAT TGCATTTTAG AATAAGGCAA AAGTTATACA ATTTAAATGT TTTTGTAAAC 420
ATCATTAGTA AATGTAATTT AATAAAAAAA AAAACTAACT TATTCACTGC AGCATTAAAA 480
AAATGGAGTA AATCACTTAA ACACAAACCT AACTTTCTCT TATTTACACA CAAACTACTT 540
AACTAATTGT TGCATGTTTC TGCATTTAAT ATCCATCCTT AATTTGCTGC TAATAACTTG 600
AAAGGTGTGT TAGCTAAGTA AGCGCTAGCA AACCCACAGC TGCACCCACA CCCCGACCGC 660
CCACCAGATA CTTGTTAATA AGTTCTGTAG TTATGCCTAA TACGTGTTTT GAAACTAACT 720
TACTTTCAGT TTTTTTTTTT TTACCAATAC AATCACTTTT AATCATTAGT TAGCGTTAAC 780
ATAAACTAGC GTAGGTTAAA TATCGTTAGC AAACTTCGTT ACAGTACAAT TTGTAAAGCT 840
AAAACCTCAC CTGCTAGCAA AGTCAGCAGT TTAGCTTGAC GTATGGACTT CGCCATTCAG 900
GTCCGCTGCT GCAAGCAGTA TACCGAGTCC GGCCATTAAA CATAATGCAT CTGCCATCTG 960
TTCCAGTCAA TGAAAAAGAG GTAACGCCGA TTTATTAAAA TCAAGTTTGA TGCACAGACC 1020
TGCCGCACAT TGGCAGCTGC ACTAATAAAT TGTGTGTAAA ATCACTTTAA AACATTTCCC 1080
GTACACAAAA CCCACATACA AAACTCTGTA CTCAAATAAA TTGCAATAGT TTTACTCAAA 1140
ATACTTTTAT ATAAAAACGG GTATATTTTA AGTAAAGAGG AAGAAAATTG ATACTTTTTA 1200
GTATAAATAA ATAAACTAGA TTGCAATAAG CCTATCTAAA GCATATAAAG CTTAGGCTAC 1260
TTTGTGAATG TAGCACTTTT AGGCAAGTCA ATGGTTTGTT TGTAGACAAT CGAGAAAAAT 1320
GT 1322