EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-14368 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr19:25170112-25171205 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr19:25170639-25170651TTTGTTTACATT-6.37
FOXK2MA1103.1chr19:25170639-25170650TTTGTTTACAT-6.32
FOXP2MA0593.1chr19:25170639-25170650TTTGTTTACAT-6.14
Foxj3MA0851.1chr19:25170636-25170653ACGTTTGTTTACATTTC-6.69
IRF1MA0050.2chr19:25171000-25171021GAAGCGAAAGTGAAACTGCGC-7.49
IRF3MA1418.1chr19:25170997-25171018GTTGAAGCGAAAGTGAAACTG+6.29
IRF7MA0772.1chr19:25171003-25171017GCGAAAGTGAAACT+6.44
IRF8MA0652.1chr19:25171003-25171017GCGAAAGTGAAACT+6.45
IRF9MA0653.1chr19:25171002-25171017AGCGAAAGTGAAACT+6.63
POU2F1MA0785.1chr19:25171187-25171199AATTTGCATAAA-6.11
POU3F1MA0786.1chr19:25171186-25171198AAATTTGCATAA-6.62
POU3F2MA0787.1chr19:25171186-25171198AAATTTGCATAA-6.32
POU3F3MA0788.1chr19:25171186-25171199AAATTTGCATAAA-6.78
POU5F1MA1115.1chr19:25171187-25171198AATTTGCATAA-6.14
Pou2f3MA0627.1chr19:25171184-25171200TAAAATTTGCATAAAT-6.16
RFX5MA0510.2chr19:25170769-25170785AGTTGCTAAGGTAACA-6.11
Enhancer Sequence
TCTTCTCCTT TGTTACAGCG CCTCAGAAAA TGGATAGTTA ATTTGTCAAT CATTGCATCT 60
TCTCGGTAGC TGTCCGGGAG CCCATTCACT TCAATAACCA TTCCCGTCAT GTCCATCCTA 120
AAACTGAGCA ATGAATAACT GTTAATGATT GTGATAAAAG TTACAAATAA CCAGTTATTA 180
CAACACAAAA TTACATTATA TTTCTTTCTT TAGTTAAAGT TTAGATGTCT GTTCATATGA 240
ACAAAATATT GGACAAACAA ATTAAACCAA TGCTGAATAC TTTCTAAATG TTACCAATAC 300
CACGTCAACT ACAAACCAAA ATCAGAAATA AACTATAACA ATGGAACCCA GATTGAATGC 360
ATTCAGAAAA TAACGCATTT GTACAGACGT TAACAAAAAT ATGAAATTAA TAACTTTATT 420
TATCTCACAA ATTGTTCCCA AATTCCTCAA CAATTCAGCA ACACGAAAAA GAATGTACCT 480
AATCCCTACT GAAACGGCGA GTGTTTAGAC CTTGTTGCTA GTGCACGTTT GTTTACATTT 540
CAGAATTCGG TTGTTAGTTA CATTACTGAA TACAGGATGA GATTGATTGT AATTTAAATT 600
AAGAGTAACG TAATGTGCAT TTAAATATTA TGTATTAAGA GTAGATCGCA AATTACTAGT 660
TGCTAAGGTA ACAGAAAAAG AAAGTTGTTG GGATATAAAA CGTGGCAAAC TAGTTTTACA 720
GCTGGCGTTT TACCAAAACA TATCGCCATA GTAACAGGAA ATCCCATAGT TTTACAAGTA 780
AAAGCGTACG GTGATTCTTG GTGGATTCCA GATTTAGAAA TTTACCTGTG GTTGATTGTA 840
TAATTTCGTT CGCCAGGATA AAAAATTAAA GAAATACTCC CTCGTGTTGA AGCGAAAGTG 900
AAACTGCGCT GATCAGAGCT TGATGAAAAC AAGGGGGCGT GCCTGAGCTC TCACAGAAAA 960
ATTACGAGTA ACTTCCTTTA AGTATTTTAA TCTGCAGCGG ACTGGAGGAC ACTTTACAAA 1020
ATACGGTTTT CTTTGAGTTT TAGAAAAGTT TTTTTTTCTG TTTTAAAAAA GCTAAAATTT 1080
GCATAAATGT CAA 1093