EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-14260 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr19:20512331-20513349 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid5aMA0602.1chr19:20512914-20512928AATAGCAATATTAC-6.18
EOMESMA0800.1chr19:20512711-20512724CAGGTGTGAAAAT+6.02
Lhx3MA0135.1chr19:20513152-20513165GAAAAATTAATTT-6.11
TBR1MA0802.1chr19:20512712-20512722AGGTGTGAAA+6.02
TFAP2AMA0003.3chr19:20512764-20512775TGCCTGAGGCA-6.02
Enhancer Sequence
CTGTCCACAA TACACAAAAT GTATACAGCA TAGACTGTCC TGATTTGGAA AACGGCACAT 60
TCAGAAGAGT TAATACTTCT AGCTCATCCA AACAGCTGCT CCTAAAATAA GTACTGTCTC 120
TGATTAACAG CAGCATAGCC CAATCTGAGC TCAGTTTATA AAAGTACCCA GCAATGCCAG 180
TCACTCTCTT GCACAGCTGT GCCGTAAGAG GATCCGATCT GTCCCTAATC CAGCCACCCC 240
TCCCCCACAA CCCCCTCTAT TCCTCCCCCA CTGCCCCTTC TGTAAATCTG GGCCGGATTT 300
TAATCTCAAT ACAACCGGCG TAGATTAGAG AATCCATTAT GAGCTTGTTG GAGCAAGGCT 360
AAAAAGGTAG GTTCATTCAT CAGGTGTGAA AATGACTCAC TGTAGAGGCG GGGATAAAAA 420
AGGTGACGAA AAATGCCTGA GGCATGAGAT ACTTCCAGTA AGAGTCCATA TGTTGACTGC 480
ACATGTGCTA TAAATGATGC ATTTAAAAGA GTAAAGTGGC TGTTAGTTTA CAGGCTAAAT 540
TAACTGCAAT CTACAGTTTT AGCATTAGTC ATTTATAGCA ACAAATAGCA ATATTACCAT 600
GACCCTATAA TAAGGCAGCT ATTTGTGTAG TTTTTAAGAA TAAGCCATGT AAATAAAGTC 660
TTTTTAATAT TTTTTTCTAC ATTTTTAATG CCTTGGACTA ATTTATACTG TTTATTCTGA 720
TGAACCCCTT CCCCAAAGAG CTTCAAAACA TTATTTAAGA TACCTCAGGG AACTTTTTGT 780
TTAATTTTAA AGCAATGTTG GTTAATTTCA CACATAAATA TGAAAAATTA ATTTCAAATT 840
TAGTAAACCG AGAGACAATG AGTTAATAAA TTAACCATGA ACAGCGACAG CCTATTAAAA 900
TGCAAATCAT AATGGGCTTT CAGGTAGAAT CTGGAGTCAT AGCAAAAGCC CATTATCTTT 960
GTAAGGTATT AGCTTACATG CTAAGAGCCT TTGTAAATCT GGAGTACCAT TGTGTAAA 1018