EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-13976 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr19:12979746-12980396 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATOH1(var.2)MA1467.1chr19:12980223-12980233AACAGCTGTC+6.02
FERD3LMA1485.1chr19:12980004-12980018GTCACATCTGTTGC-6.33
RUNX1MA0002.2chr19:12979880-12979891GTCTGTGGTTT+6.62
Enhancer Sequence
ACATGTCAGC TAATTGCTTT ATGAAGCTAA AATGCTTTAC AAGAGATTTT AAAGGCTGTG 60
TGAGTGATGT CATCCTCACA CATAAGTCAG TAGTGTTCAG TTCTTTCTAA TGGCTCCATC 120
CTCTACATTT CATTGTCTGT GGTTTGGGAG CTGATGGGAT CTGTTGGCTG AAAGAGTTGT 180
AGTCAGATCT TGTAGTGCAT CATAATTGTA AACACCACAG CCGTTTACAG ACACAAAATG 240
GAGTCACGTA GTCTTAATGT CACATCTGTT GCTAGTGCAT ATTTTCTTGA GATGAGAGAA 300
TTGAGGTTTA TCTGCATAGC AGTCACTAGC TGGCCTTCGT TATACACAAC CCCTAAACCT 360
CACTCCCATC CACGTCATTG CACCAATGGA ACCCACCAGT CCTACACAAC CCACACACTC 420
CAAGCTGGAA TTAAACCAGC AATTCTTTGC ATGCTAATGC TTTACCAAGG AGGTGAAAAC 480
AGCTGTCTCT AGCATCTGTC CTTAAGATCT CAAAACTCAG GGATTCTGGT AGTACCCAGA 540
ATAGCGAAGT CTACTAAAGG AGGTCGAGCA TTCTCATTTA TGGCTCCTAA ACTGGAATAG 600
CCTTCCTAAT AATGTCGGAG ACTCAGACAT ACTCTCTCAG TTCAAAACTA 650