EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-13897 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr19:10277723-10279154 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RORA(var.2)MA0072.1chr19:10278340-10278354CTAAAGTAGGTCAG+6.17
RORA(var.2)MA0072.1chr19:10278382-10278396CAAAACTAGGTCAG+6.57
RORCMA1151.1chr19:10278383-10278395AAAACTAGGTCA+6.02
ZNF24MA1124.1chr19:10278149-10278162TATTCATTCATTC+7.52
Enhancer Sequence
GAAGAAGCAG ATAGTTTACG TTTATGTATA TTTATTTAAA TTTGAATGAC AAATGTGTTG 60
GTTTTGTGCA TTTACTTAAG ATTTAAAGAC ATGCATAATA TGGAAATGTA TATTTATTTT 120
AATTTACAGT ATTCAGTACA GTATAGCGAG TTGTTTTTGC ATGAGTTAAG CTTGTAATTG 180
TAATAACATA TACATAATAA TAATAAAAGC ACCAAGTCAT TGATCTTAAA AGTCCTAAAT 240
ACATCTCCTA GCACGGTCTG TGTTCGAGCG AACTGCCCAG TATATCGCCT GTTGTATTGG 300
ATAATGTACC TACAAAATGT AAACACTTGA TAAAACTAGC CAAAACATAA GCAGCTATTA 360
CAATCCGCAG TAAGTTTTTT CCCTTCAAAT TCAATGTGTG GCTCCTAGCA TCGTTAACCA 420
CCATCATATT CATTCATTCT CTCCTATATT ACAAGTTGTC ATTGGCTAGA ATAAGCCAAA 480
AACGTGAGCA TATCAGTTCG GCCGACACAA ATGTATTTCC ACAGTACCTT AAGGCCAGCA 540
CTAGAGCTCG TAGCGCGCAC ATGGCTCAGG CACGCGCGGA CGCAACCTAC CGGCGGCCTC 600
TCCTTCACGC GATTGGCCTA AAGTAGGTCA GTATCTGCCC TTCGCGAGAT CCAATTGGAC 660
AAAACTAGGT CAGTCGCTCC TCCCAGTGTT CTCCCCATGC TAGTGCCGCG TGAGATGGGA 720
GTAAAACAAC ATGCAAAGGC GGCTTGGTGA GATCTTTGTG GATTAGTGCC GGCAACTCTT 780
GTCAGATGCA GAGATCAAAT GGAATCTGCC TTTGCGTGTT TGAAAATGAA AACAAATACG 840
ATGGAGGGTC CATCCGCGGG GATTGTTGTG CATATTTGTG CAGACAGACT GCATTTACTG 900
TGCATCGTTT CAAACGTGAA TCTGGTCTTC ATTTGCATCG AAAAACAAGA ATCAATGCAC 960
TTAAATAAAT AAATATCAGA TTATTAAAAG AAACATTAAT GTAGATATGT ACTTGATGTA 1020
AAATATAATT ATCTTAAAAA CTGCATAATA TAATTACACA CAGCCAAATG CAGAATGTTT 1080
AGCCGTTAAT TTACCAAAAC AAAAAGTTTA GGGGGAGAAA GCGCAGATTT CTTTTGCAAA 1140
CGGAATTAAA AGTGCAGTTT TGTGAAAAGG TGACACATAC CCAAAACAAA AGTGATCGCC 1200
TACCAAGATA TACATTCGCT GGCCACTTTA TTAGGTACAC CCTACGTGTA CCGGGTTGGA 1260
TCTCATTTTG CCTTCAGAAC TGCCCTAATC CTTTATGGCG TAGACTCAAC AAGGTACTGG 1320
AAATATTCCT CAGAGATTTT GGTCCATATT GACATGATAG CATTACACAG TTGCTGCAGA 1380
TTTCACTGCA CATCCATGAT GTGAATCTCC CATTCCACCA CATTCCAAAT G 1431