EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-13855 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr19:9000356-9001420 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EHFMA0598.2chr19:9000470-9000482TACTTCCGGTTT-6.02
ELF1MA0473.2chr19:9000470-9000482TACTTCCGGTTT-6.07
ELF2MA1483.1chr19:9000470-9000482TACTTCCGGTTT-6.32
ELF4MA0641.1chr19:9000470-9000482TACTTCCGGTTT-6.11
ELK3MA0759.1chr19:9000470-9000480TACTTCCGGT-6.02
ETV1MA0761.1chr19:9000470-9000480TACTTCCGGT-6.02
ETV2MA0762.1chr19:9000470-9000481TACTTCCGGTT-6.14
ETV4MA0764.1chr19:9000470-9000480TACTTCCGGT-6.02
IRF1MA0050.2chr19:9000747-9000768GTTAAGTTTCGTTTTCATTTT+7.08
IRF3MA1418.1chr19:9000750-9000771AAGTTTCGTTTTCATTTTCTC-6.98
IRF9MA0653.1chr19:9000751-9000766AGTTTCGTTTTCATT-6.41
STAT1MA0137.3chr19:9001150-9001161TTTCTGGGAAA+6.02
STAT3MA0144.2chr19:9001150-9001161TTTCTGGGAAA+6.32
Enhancer Sequence
TTGAGCTGTT GACAGTCGTA TATGTGTCCC ACACTGCTAA AAACACTATT AAGACACCTA 60
TATTTCACTA AAAAGTGTAA ATTGGTTGTT TTTGCGTTAT TTCAAGCAAA TTCATACTTC 120
CGGTTTGAAA CGAATTTTTG AAGCTGCGTC ACGGTCATGA CATAATAGCG TTGTATTCCA 180
GCGTGCAGAC TGGACGTCTG TGCCAGAGTG AGTCTTATTA CGTCTTACAG TGTGATGCAT 240
TAATGCATGA GTAAGGCTTG GTTCAAACCA ATCAGCGCAC TCTATTGTGC AACTTCATTA 300
ATATTCATTA CTATCACCGT GTTTTCAGGA CAGAGACGCC ACGTTGTGTT GGCAAAACAA 360
GCGTGAAGTG TTGCTTTTAT AGTTTGCTGC CGTTAAGTTT CGTTTTCATT TTCTCCCTGT 420
GAGAGCTCAG ACTCACGTGT GGATTAACAG TGAACGCGAC GCGCGACAAC AATAACTTAC 480
GTGTCTAAGG AGGAACATTG TTTACCTGAG AGCTGTTCTC ATCTGCAAAC GCTGAGATCT 540
GGATTCGTTT GTAGTATTCT CTTCATAAAG ACGCAGCTCT AGTTGCTGGT GATTGTCCTG 600
TCTCTACAGA TTTGGTAAGT GAGCGACCAG TGCTCTTTGT TTATTCAGTT TGTTCGTATC 660
TAACAAACTA TTGCACAGAG TGTAAACATG TTAGCACCAC AACCAATCTT TAACCTCGTT 720
TAGGGTTTTT ACCGCATTTA GTGACCGGAA TAACACGCGC GGCTTTCTGA CGCTACCTGT 780
CGTGTGCATC TAAGTTTCTG GGAAATGCGG AGTTTTTTTT TCTCTCATTC GCCGTGCGGT 840
ATAAAACATT ACATGAAAAA TACACGCTTA GAGCAGCTCC TCGAATCAAA TATCTCGTGT 900
GTCGCGAGGG GCATGAATGA ATTCCCTGAA TGAAAGAGCC AAACTGCAGT TAAAGTCCAA 960
CATTTAATAA TTTGGCAAAT AATTCGACTA CAGATGTCCA TGTAGGTTAA ACACCATCAT 1020
TTTCTCCTGT ATGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT ATTT 1064