EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-13709 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr19:3850917-3851931 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA13MA0650.2chr19:3851916-3851927GTTTTATTGGG-6.62
HOXB13MA0901.2chr19:3851916-3851927GTTTTATTGGG-6.62
HOXD13MA0909.2chr19:3851916-3851927GTTTTATTGGG-6.62
IKZF1MA1508.1chr19:3851140-3851152ACTTCCTGTTTG-6.02
Sox11MA0869.1chr19:3851504-3851519AAAAACTTCAGTGTT+6
Enhancer Sequence
AGGTGGTCAG GCTGGGAGAT GACCAGCTAA ACCCAGCTTG ACCAGCCTAG AAAGGCTGGG 60
AGAAGCCAAA ACCAGCTATA TCTCCAGCTT AAACCAGGCT GGTCAAGCAG CTTTTTCCCC 120
TGACAGGGTT CGGAAACTGG CCTATTCTGC ATGACTGAAG CTCTATAAAT GACAGTATTC 180
AGCTTTTCCA CATGTGACTG CTGCTTTTCA AATTATGGGT TGCACTTCCT GTTTGGGGAA 240
CTTCCATTCA AAAGAACTGA AACAAATAAT TTAGAAAAAA AGTTGTTCAT CAAAGTTATC 300
CATATAGACA GTGAAAACTA TGTGAGACGT ATTTGCAGCT GTGCTTTTTT ATTTGACATG 360
AAATTATTAT TATGCTTGGT GTATTATTAT TTAAGCATGT GGCATACAGT ACATTTAACA 420
TGTCCATAAT ACTGCTGTAG TGTATAATTC ATGCCAAGAT GGACATTGAC ATTTGTTGAT 480
TCAAGCTAAT CCTTAATAGC CACTATGTTA GCTAACAGCT ACATGTAAAC AACAAATCTG 540
AGCCTCTGAC AGAATCTTTC ATCTCTCTGT ATGCTTGAGA ATGCCTGAAA AACTTCAGTG 600
TTTTGTTATC TACAGCAGCA GATTTGCCTA AAGTTTATTT GCTATGTTTG ACAGCAGATG 660
ACAACAATCA AGTACAAGAT AAAATCTGGA AGCCACAAAA ACGCCAGTGT TGTTTTCTGT 720
AGATGTGATG CTTCTGCCTG TTCGGTGAGC TTAGATTTAC TTCAATATTT GAGTCAGATT 780
GTTCTGAAGC ACGACAAAGA TGGTGTACAG ATATAAATTA TCCACCTGAG AAACATTTGC 840
ATTTACATAT TTTAAACCAT ATCATATAGT CTAGACCAGG GGTGTCCAAA CTCGGTCCTG 900
GAGGCTCGGT GTCCTGCACA GTTTAGCTCC AACTTTATTT ACACCTGCCT GGAGGTTTCC 960
AGTACACCTA GAAAGAGCTT GATTAGCTGG TTTAGGTGTG TTTTATTGGG GTTT 1014