EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-13680 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr19:2941971-2943019 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRT3MA0610.1chr19:2942944-2942955AATGTATCAAA+6.02
ZNF384MA1125.1chr19:2942844-2942856AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr19:2942845-2942857AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr19:2942846-2942858AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr19:2942847-2942859AAAAAAAAAAAA+6.22
Enhancer Sequence
AAACTGCCTC CGGCGAAAAG ACTTTTTACT TCAGCGAATA CTTAGCTCAT GAATATTAAT 60
TTGGCGTAAT GACGTTCTCT CGACAATCGT CCAATAAAGG AACACTTGCC TTATGAATAT 120
TAAGTGTGTC CTCAGGCTGT GCGGAGAGTT CTCAATCCTG ATTGAGGAAC ACCAAGGAGT 180
CATGTTTGTT GAGATTATAA ACTAAGAGCT GTCACAGATG AGTGGATTTT CCGCCTGAAA 240
AAAACGGAAA GAAACTTTTA TATTTTTCCT ATAGTATGTA ACGTTAGTCT GTAGTATATA 300
TATTAGAGTC TCTTCTCTTG ATTCGAGCTA AAGTGTTTCT TGAATAATGC AATCGCATTT 360
TTCCAGCTGT TCTCTCGTGA ACGCAAGTTT GTACAGGTAA ATGCGCGCGC ACACGCCCTT 420
CACAACTGCC AGCAGAATCA GGAAGCGCGA GTCCGCGAGA TCCGTCGCAC TGAACTCAAT 480
CCACCATGCG CGACCCAAAG GTTTAAAACA ACCCGTTTGT ACCGCATAAA TACATCGTAG 540
TGGAAGTTCT GGGAAGCTCT GAAGGAGAAC GATGGGTTCC AGTGCGGTCC CGGTGCTCAT 600
TGGACTCATT TTATTGCACA TTCACAAAAT CTCAGGTGAG TCTTTACAGA AGCGCCACCC 660
CAAACACGTT CAACACCCTT GCTGCTGTCA TTTCGCAACT TTTAGTTAGT TACTTCATAG 720
CAGTTCGATC TGAAGTGCTT AAAATATGTC AGGTGTGCTT GCTAATTATT GTGAATTGGG 780
TTAAGTTGGT TTTATCTTCG CACGTGCAGA CTTCTATTAT ATAATTTTAG AAAGGCATTC 840
TTTGCAATTG CTAAACAGGT AAATATTATT AGCAAAAAAA AAAAAAAAGA CTATCAAAGT 900
ACAACATTGT TTACAGTCAA TGAATTAGTG CTAATGTTGT TTTGGAGTCA TACTTGCATG 960
CAGTTTCTGA GCGAATGTAT CAAACTAGCG TGGTAAACAA TATATGACGT CACAAGTGGT 1020
CACTTGGTTA TAAGTGAATG TGCCAATA 1048