EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-13645 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr19:1742669-1744080 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr19:1742898-1742911TAATTAATTAATA+6.25
Lhx3MA0135.1chr19:1742890-1742903TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr19:1742894-1742907TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr19:1742887-1742900AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr19:1742891-1742904AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr19:1742895-1742908AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr19:1742886-1742899AAATTAATTAATT+6.92
NFYAMA0060.3chr19:1743222-1743233TCTGATTGGTC-6.14
POU4F1MA0790.1chr19:1742751-1742765TATTAATAATTCAA-6.13
POU6F1MA0628.1chr19:1742888-1742898ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:1742892-1742902ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:1742896-1742906ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:1742900-1742910ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:1742888-1742898ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr19:1742892-1742902ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr19:1742896-1742906ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr19:1742900-1742910ATTAATTAAT-6.02
RUNX1MA0002.2chr19:1743442-1743453GTTTGTGGTTT+6.02
Enhancer Sequence
CGATGCTTTA TTATAATATA AACAATGATG ACGTGCCAAA AGAAACTCCA AATAATATAA 60
TTATGTGATT TTCTTTGGTA AATATTAATA ATTCAAAGTT TCCCAGTGAT GGGTTGTGGG 120
TGGAAGGCCG TCCGCTGCGT AAAATACATG CTGGATAAGT TGGTGGTTCA TTCCACTGTG 180
GCGATCCCTG ATTAGTAAAG GGACTAAGCC AAAAAGAAAA TTAATTAATT AATTAATTAA 240
TAATAGTTCT TATGATGGTA AAATGTCACC AGGTGGCGCT TTATATTTAA AATTAATTCA 300
GAATCCATGT ATACGTGTAG TAAAAATAAA ATATATTGCA CTTACTCTCG ATAAACGCTG 360
AATTAGTTAG ATTTAAAATA ATTTTAGACG TACTTTAAGA AACTTAATCG CGAGTTAATG 420
TAAAGAGGCT TTATAATGTA ACCCAGCTGT GTTATTCCTC TCTGTAAGGA AACAAGTTTA 480
AGAACTCTAC TATGGTGACT GTCTTACCTT ATGAATATTA AGTACATAGA CTGACGTTCA 540
TATTTTAGCT ATATCTGATT GGTCAAAAAG GCGGGCACTA AGTCACTCGG CGAATCAGCG 600
TGACGTTGTA AAGTGACCGC GGGACATATT AATATTAATG GGGTATTCTG ATTGGACACT 660
TTAAAGGAGT TTCTAAGCAA CGACAAAATT GCGTTATTAA TGTCAATGAG CCAAGTCTCT 720
TCAACAGTGT AGCTTGCTAG TTTTTTCGCC ACCTGTACTG GTTCTGAGTT TTAGTTTGTG 780
GTTTTCATTC GTTCAGAAAG AGTCTGGAGA CAAGTCTACA GTGTGTTTAT GATCGTAATG 840
AGGATGATAC TGTAGCTGAG TGTGATTTAT ATCAACAAAG CGCTTTATTT GTTCACTTTC 900
AGTCGTAGTT GTCCTCAGGA TCAGTGATTG AGAACATAAC GTTAGCTTGG AGCCTCAGCA 960
GCGGCGGACA CTGAAGGTTT GTTTATTCTC CTCTTCGTTG AGTTGTGATG AGCATTTTGT 1020
TGCTCCTGCT GCATTGTTTA GATTTTTTAT TCATGGAAAA AGTCATGAAA CTTTGATTGA 1080
ATTGTCCATA CAGGACATGT TACATGTGTT TAATCAGTAA AGCAGCTGGT TTATGCGCTT 1140
ATGAACAACT TGGGCGTTTG TTTTACTTCA GTTTCGTTTG TAAATGTGCT TAAATGACTG 1200
TCAGAAAGTG AGAGTTGATG TGAAATAGTG CATGAAATTT CCTATTTTCA CACTGATTAT 1260
TATTTGCCTT TGTTTAAGTT AGTCTTGTTG AGTTGAGCTG TTGACATTGA ACTTTTCCAC 1320
ACTATTAAGA ATTAGGGTGA ACGAGTATAA AGAGTGTGGC TAGCGTTATG TGTAACAGTT 1380
ACATGATTTG TTGTAACGTT AGAAGTGTCT T 1411