EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-13618 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr19:1002295-1003253 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXP1MA0481.2chr19:1002730-1002742ATGTAAACAGAC-6.44
FOXP2MA0593.1chr19:1002730-1002741ATGTAAACAGA-6.02
NFYBMA0502.1chr19:1002600-1002615AAGGGGACCAATCAG-6.19
POU2F1MA0785.1chr19:1003089-1003101AATATGCAAATG-6.74
POU2F2MA0507.1chr19:1003090-1003103ATATGCAAATGTC+6.19
POU3F3MA0788.1chr19:1003089-1003102AATATGCAAATGT-6.03
POU4F2MA0683.1chr19:1003102-1003118CGCATTATATATGCAT+6.05
POU5F1MA1115.1chr19:1003090-1003101ATATGCAAATG-6.32
SP1MA0079.4chr19:1002927-1002942TGTGGGCGGGGTTTG+6.37
SP2MA0516.2chr19:1002926-1002943ATGTGGGCGGGGTTTGG+6.37
SP4MA0685.1chr19:1002925-1002942TATGTGGGCGGGGTTTG+6.43
Enhancer Sequence
AATATTAGGT CTGAAATACG ACTTCAAAAC AACATCAGCA CTATTTAATT GACTATGAAC 60
AATGTTTACT GCTATTAATA TTATTTCCCT ATTTGGAATT GGCAAGGAAC ACTTTTCTGA 120
CATTATATTA TTGAGGAGAA TGTCCTAAAT GTGCGATTAT AACGCCGCAT TTACCTCAAT 180
GTCAACATCA TCTGCACCAT TCAAACATTT AATAGCTTCC ATCTTTATTA TTGTAGCTAA 240
TGGAAAGTAG CGCATCCCAT TGGAAGAAGC GCGAAGACGC GAACCAAGGA AGATACCGCA 300
GTGATAAGGG GACCAATCAG CTGCTGACAT CAGTGCAGAT GAATGATGAC GAATCAGATG 360
TGAAGGATGA CAGCGCGCAC GCATCAATCA GCAGATCAAA CAAGCCGCCG CAGCGCAAAC 420
GCTACAATGT ATCGAATGTA AACAGACTCA CCCTGACGTC ACCGCGCGCT GCTGTTAGTG 480
TGTTTATTTC TGTCTGTCAG AGCGGCTGTT GTTGTGTTGC GCTGCTGCTC TGCTCTGCTC 540
TTCAGCCGCG GTTATAATGC GCCTTTAAAG GCAGGATCTG TGTGACAGAC GAGAGCCGCT 600
TCCGCCGATG GATATGGAGC GTGTTTTGCA TATGTGGGCG GGGTTTGGAA TTTAAAGGTA 660
CGGCATCAGC AACCACCTGA CTGCTGGACA CCAGTGCTAT GAAGATACAT AGATTTGTGT 720
GAATGGGTTG TATGTGTGCT TTTGTACTAC ACATTATAGC TACTAAGAGA GCTGTATGGT 780
ACTATTCAAT CAAAAATATG CAAATGTCGC ATTATATATG CATATTGATA ATGCTATTTT 840
GTTATTGAAA TAAATAATTT TGAATATAAA AATATGCAAA CCATTAGCGA AAATAGCATT 900
ATTCAAAACT ATTAAAATTA TTTAACAGCA CTAAAAAGGA AAAAAGCACA TTAGAAAA 958