EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-13555 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr18:50702671-50703019 
TF binding sites/motifs
Number: 21             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE23MA0817.1chr18:50702924-50702936CAGCATATGTTT-6.04
RFX1MA0509.2chr18:50702681-50702697AGTTGCTATGGTAACT+6.3
RFX1MA0509.2chr18:50702681-50702697AGTTGCTATGGTAACT-6.3
RFX1MA0509.2chr18:50702735-50702751AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr18:50702735-50702751AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX2MA0600.2chr18:50702681-50702697AGTTGCTATGGTAACT-6.61
RFX2MA0600.2chr18:50702681-50702697AGTTGCTATGGTAACT+6.66
RFX2MA0600.2chr18:50702735-50702751AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr18:50702735-50702751AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX3MA0798.1chr18:50702681-50702697AGTTGCTATGGTAACT+6.25
RFX3MA0798.1chr18:50702681-50702697AGTTGCTATGGTAACT-6.26
RFX3MA0798.1chr18:50702735-50702751AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr18:50702735-50702751AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX4MA0799.1chr18:50702681-50702697AGTTGCTATGGTAACT-6.23
RFX4MA0799.1chr18:50702735-50702751AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr18:50702681-50702697AGTTGCTATGGTAACT+6.64
RFX4MA0799.1chr18:50702735-50702751AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX5MA0510.2chr18:50702681-50702697AGTTGCTATGGTAACT-6.88
RFX5MA0510.2chr18:50702681-50702697AGTTGCTATGGTAACT+6.94
RFX5MA0510.2chr18:50702735-50702751AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr18:50702735-50702751AGTTGCTATGGTAACA+7.14
Enhancer Sequence
GTGATTCTAC AGTTGCTATG GTAACTCAAC AACTACAGTA ATTGATCTGC TGTGGTGATT 60
CTACAGTTGC TATGGTAACA CAACTACAGT AATTGATCTG TTGTGGTGAT TCTACAGTTG 120
CTAATGAGGA AATGAGGACA GAATTGTTGA GTGAACTCTC CCTGTAAATC AATACAAACT 180
CATTCATTTT ATTTTCAGCT TAGTCCCTTT ATTAATCAGG GGTCGCCACA GCAGAATGAA 240
CCGCCAACTT ATCCAGCATA TGTTTTGTGC AATGGATGCC CTTCCAGCTG CAACCCATCA 300
CTGGGAAACA CCCATACACA CTCAAATGAG TCACTTATTT TTGTGTGT 348