EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-13538 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr18:50108169-50109339 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr18:50109188-50109198GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr18:50109188-50109198GTCACGTGAC-6.02
Foxq1MA0040.1chr18:50109063-50109074TATTGTTTATA+6.32
MITFMA0620.2chr18:50109184-50109202TACTGTCACGTGACCTAC+6.45
MITFMA0620.2chr18:50109184-50109202TACTGTCACGTGACCTAC-6.46
MNX1MA0707.1chr18:50109106-50109116GGTAATTAAA+6.02
NFYAMA0060.3chr18:50108767-50108778GACCAATCAGA+6.14
PBX1MA0070.1chr18:50108748-50108760TTTGATTGATAG-6.18
RORBMA1150.1chr18:50108566-50108577AATTAGGTCAT+6.32
SOX10MA0442.2chr18:50108974-50108985GTCTTTGTTTT-6.14
USF1MA0093.2chr18:50109188-50109199GTCACGTGACC+6.14
USF2MA0526.2chr18:50109186-50109202CTGTCACGTGACCTAC-6.13
Enhancer Sequence
TTATCACCTA TTACTTTTCA ACATATTGCA CCCTTAAGTC CTTTTTTATA TGATTTAGCA 60
TCTTCCATGT TTAGACATAG TCCTCACTGT GCTTTAGACA ACACAAATAG ACAAAAAAAA 120
CATGTTTTGA CTGTATGCTG TTGTTTACTT ACATAAGCTG ACCAAATATT GTGCACTATG 180
GCATTTGTCT TGTGAACGTG GTAGATAAAA TAAAAACTGC TGCACTGTTT AAATAAGTTA 240
TTGAACATAC TATAGTGACA CAGCAGGCAA TATTTCCTGT ATGAGCTAAT TCTCGTGTAG 300
ATGGAAATTA CTGTATGATC TGCCTGAGGG TTTAACTCTT ACTTCACGAT TCTCGCAAAA 360
CATCTGTTCT TCTGCACTGC AGCGTGTGTT AGAAGGAAAT TAGGTCATTC TGATACTGGT 420
TCCAGCTGAG GTAGTGCTAG TAAAGTAGAC ATTTCTCATG TACAAAGACG TTCCTCATTT 480
ATTTACTTTA ATGGCAAACG TAAAAAACGC GGAATATGGA GAACTAAGCC CCGCCTTTTA 540
AATAAAAGCG CCAATCATCA ATTGAGCCTT CAAGTGTAAT TTGATTGATA GGTGTTCTGA 600
CCAATCAGAG CGCAGATGTT ATGATGAGCC TCGTTTACCG TCTGTTTTGT TACCTCAGAC 660
AACAATTAGC GTGGTTAGGT TAGGTTAGCA TCGGTGGAGA TGAACAGTTT GCAACGGGTA 720
TGTAGACTGG CTGAGGAATA TGCTCGCTTT ATGTCTACTA TTGTCTGTTT CAGTTGTTCA 780
AACACACTTT AATGATGTTT GTTTTGTCTT TGTTTTGACA AAGGCTCAAA TCTTTCGTTG 840
GTTTTGTGAG AATAAGTTAC AGTAATCCTT TCACAGTTTA AAATTAGGTT ATATTATTGT 900
TTATACAACT CAAAATCATG GCATTTTACA CTCTTTAGGT AATTAAAATG TGCGTTAATC 960
CACCCTACTA AAGGCCTCAT AGACTTGAAC TTAAATATCC CTTTATTGGC CATGTTACTG 1020
TCACGTGACC TACCCAAGCC AACATTTTGG AAGATTTATG TTGTAATATG TAACTTACGC 1080
ATAACAAATT TAGCAATGCA TCTTAGGTTG TTGTGTGTTT TCGATATGCT GTAATAAATT 1140
TAAGTATTGT TTTTTACCAT ACATATGTAG 1170