EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-13498 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr18:48434278-48435161 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXC13MA0907.1chr18:48434378-48434389GCTCGTAAAAC+6.14
IRF3MA1418.1chr18:48434301-48434322AAGTTTCCTTTTCCTTTTCGT-7.2
Nkx3-2MA0122.3chr18:48435015-48435028TATAAGTGGTTTT-6.3
Enhancer Sequence
CCTCTTCTCC CTCTCTCTTT CTCAAGTTTC CTTTTCCTTT TCGTCGAAAC TTTGTTGAAA 60
GTTGAAAGCT ATAGCGGAGG ATACGCGCGT TCAGACGCAC GCTCGTAAAA CTAACGGGCT 120
AGACTCGCTG TTGTGATGGA GCAAAGAGTT GAGGGAAAAT CCGCTTTGTT TTTAAGATGA 180
AAACAGCGAA TGTCTTCTAG TCGACGAGAC TGCTTGCTTT GGGTTTTCAG GATATCGTGG 240
CGCGCGCGCG TGTGTGTGTA TGTGTGTGTG AATGCAGTGC AGTGGTTTGT ATAAATCATA 300
AAGCTTTAGG CTGGAGATGT GGCTGCGCAA TTGGAGTGGC ACCGTGCCGA GGTTTTCCAA 360
CCATTCATAT AGTTCAAAAG CGGAGCCCAC CCACAATAAA ATATCACTCC ACAGTCTTTG 420
CCGCATTCTG ATAACTCAAA ATAATTGCTA TAAGCTAATC TTAATTGGGC TGTGATATCG 480
CAAATTAGGC TGCTTAAGAA AAAAAAAACG CGGTCTGCTT AGAATAATTA GCTATGTGTG 540
GTCCTCACAT TTTCAATCTC CAAATAGCTA TTTTAACATG TGCATAATTA TTAAATCCAT 600
GTCTGAAAAG ACACCAGTAG CTATTTGAAT TAAATATTGG TGAGCGTCAT ATTTAAGGTG 660
TAATGATCTC TGATTAATTG TTGGCTCCTG TCTGGAGGGG AGGGCTACAA ATGCAAACAC 720
TCCTTTTTTT GCGGTCATAT AAGTGGTTTT GGGTGTGGTA TATGTTTGGG GCCGTACACA 780
TCATGCTTGT GTTAGATTTT ATCATGTTAA ATTGGCTTTT TTCGATAGCA ATGGGGTGAC 840
TGAGGACAGA AAATGGTCTT TTTTGGCGCA TAAAGGGCAA AAG 883