EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-13315 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr18:39206293-39207487 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr18:39206509-39206526CGTTTTAATTAATAAAC+6.24
Alx4MA0853.1chr18:39206509-39206526CGTTTTAATTAATAAAC+6.86
Foxo1MA0480.1chr18:39206481-39206492TCCTGTTTACA+6.62
IRF1MA0050.2chr18:39206493-39206514TATGAGAAAGTGAAAGCGTTT-6.11
IRF2MA0051.1chr18:39206497-39206515AGAAAGTGAAAGCGTTTT+6.03
LMX1BMA0703.2chr18:39206510-39206521GTTTTAATTAA+6.14
POU4F1MA0790.1chr18:39206664-39206678TATAAATAATTCAT-6.13
POU4F3MA0791.1chr18:39206665-39206681ATAAATAATTCATTAG+6.15
Enhancer Sequence
CACATGTAAT GGATTAACAC GGGACCCGGC CGGTCTGTGG AAACAAAGGT TGGTGATTCA 60
GCCACGTTGC AGCAGTGTGT GAGGGAAATG ATGGCTAACC GGCCGACCAT TTTGTTAACT 120
AAAAGAGGGA GCCAACAAAC CTTAAACCAG TCCAGTAACG TTAGTGACAT TAAATCAACA 180
CCTATTAATC CTGTTTACAC TATGAGAAAG TGAAAGCGTT TTAATTAATA AACATAAACC 240
CATCATGTTG CTTAACGTTA TATGGATTGA CCAGTAAAAC ATGTTTAAAT GCTTTTATTG 300
ACAAGGTTTA CCAACTCATC TCAAACACAA AAAGTAAATA TAACGTTACT AAGATTATTT 360
CTGAACAAAT ATATAAATAA TTCATTAGGT ATTAAAGCGG CTTGTTTAAA AACTTTGAAA 420
AAATGCAATA ATGACGCAAA CAATAACTTG GCGTTGTTGT ACACACGCGG TTCGCTTTTG 480
TTGCTGCTCT GTTAAAGTTT ACAGTTGATC GGCTTGTTTA TATGGTTTAT TGGCCATTTT 540
CGGTCCTCCA TTTTACTACC GGCTACATGC TAAAGCTAAA ACCAAACCGG CTCAGAGACG 600
AAACATTGGC ACAATTCAAA AACAACTAAA CTGAATTAAT TACCCAGTAA AAATATGAGT 660
ATCCGCGAAT ATACAAACTC TACAAAATGT TCGTAAGCAT AAATCGAACA TTGTTTCTAA 720
GACAGCGGGA GAATTCACAT ATACACCAAT TCGCATTACA AAGGATTAAT AAACAAGCTA 780
TTAGGAGTTA AATAATCTTC TTAAGTATTA TAATGTCTCG TATATCAGTA AACAATGTAT 840
TATAACGATT TAACAGTCAT TTCTTTATGC ATTTACGGCG CTTCGACGCG TTACCTGAAC 900
AAAGAAGGTT ATTGTGCCGA GGCTAGATTT CACCAAGCCG CCCATTTGCC GTTAAAATAA 960
ACCCTTTAAC CCAGCAAAAC GACCATATTT ACGCTTACAT ACAAAGCAAA GAAACAAGCC 1020
ATGTACTCAC TCTTCTCGCT GGTGTCATGT ATATTTTATT CCTAACCGTT CCGGGCTAGG 1080
TTTGTGTGCG CTACCTGCGC GCTCTCCTTA CAGACTGCTG TGTGTGTGAG TGAAGCTCTT 1140
ATGTTGAAGA TCAGTGTGAA TAAGCGTTGC GACGCATGCG CATTAATGCG TGCT 1194