EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-13216 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr18:34019152-34019881 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr18:34019712-34019722TTTAATTAGA-6.02
ARGFXMA1463.1chr18:34019712-34019722TTTAATTAGA-6.02
Alx1MA0854.1chr18:34019341-34019358TGATTTAATTAATCAGT+6.36
CTCFMA0139.1chr18:34019173-34019192TGGCCACCAGGGGGCCCCC+6.93
CTCFMA0139.1chr18:34019404-34019423CCGCCACCAGGTGGCGCTT+7.24
CTCFLMA1102.1chr18:34019177-34019191CACCAGGGGGCCCC+6.43
FOXA1MA0148.4chr18:34019455-34019471CGTTATGTAAACAAAC+8.27
FOXC2MA0846.1chr18:34019458-34019470TATGTAAACAAA+6.74
FOXD2MA0847.2chr18:34019456-34019469GTTATGTAAACAA+7.04
FOXK2MA1103.1chr18:34019459-34019470ATGTAAACAAA+6.32
FOXP2MA0593.1chr18:34019459-34019470ATGTAAACAAA+6.14
IRF7MA0772.1chr18:34019216-34019230ACTTTCGTTTTAGT-6.18
LMX1BMA0703.2chr18:34019342-34019353GATTTAATTAA+6.02
Enhancer Sequence
AAGCGGCTGC TTAGGGCCCC GTGGCCACCA GGGGGCCCCC AAGAGTGCTT AAAATTATTG 60
TGTGACTTTC GTTTTAGTTT GTCAAGTTGT GGATTAGTGG TGGGACAAAT TATATGCCCA 120
TTTATAGTGT TATTTATGAC GCGATACATA CTCAGGCGCC AAGATATTTA CCTAAATTTA 180
CAAAAGATCT GATTTAATTA ATCAGTTTTC AACCCCGACA GCAGATAACC GCATTAGCTA 240
CAGTACACCC AGCCGCCACC AGGTGGCGCT TCCCGTAATG GCGGATCATC GGACATACCC 300
CAGCGTTATG TAAACAAACT GAAAGACAGA TGATTGCAAT GGTGAATATC TCAGGCATAC 360
AGACACTTTC TTCTGTCCAA GCTGGGCCAA TGTATTTGTG TGTTTCAGAC ATCCAGCTCC 420
CCCGAATTTG CCACTAGTTT CTTTCTAACA GACGCGCTTT CACTTCGCTA TATCGCTCGC 480
GCGTGCCCGC GGCCAGTGCA ACTTCCTATG TGCTCAAACT TTTTAACTCC GCCAAAATAT 540
ATATCAATAG GACATGAACA TTTAATTAGA AAGGCCTTGC GTTTATTTGA CTCTTACAGA 600
CCTTGTCAAA GTCTTGTAGA TGGTATTTTG GCAAAAAAAA ATGTTAGGGG AATTAAAAAA 660
CTTAAATAGA TGAGTAAATT ACTAATGTTC TCCACTGCTA AAAACATACG TGCTCAGAGG 720
AGTCTGTGC 729