EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-13027 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr18:30052174-30056228 
TF binding sites/motifs
Number: 29             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATF2MA1465.1chr18:30053343-30053357AAATGATGTCATCA-7.95
ATF2MA1465.1chr18:30055309-30055323AAATGATGTCATCA-7.95
DUX4MA0468.1chr18:30054365-30054376TAATTCAATCA+6.14
ELK3MA0759.1chr18:30054186-30054196ACCGGAAGTA+6.02
ELK3MA0759.1chr18:30056152-30056162ACCGGAAGTA+6.02
ETV1MA0761.1chr18:30054186-30054196ACCGGAAGTA+6.02
ETV1MA0761.1chr18:30056152-30056162ACCGGAAGTA+6.02
ETV4MA0764.1chr18:30054186-30054196ACCGGAAGTA+6.02
ETV4MA0764.1chr18:30056152-30056162ACCGGAAGTA+6.02
Foxd3MA0041.1chr18:30054856-30054868AAACAAACAAAC-6.32
Foxq1MA0040.1chr18:30052367-30052378AATTGTTTATT+6.02
Foxq1MA0040.1chr18:30052299-30052310AATAAACAATA-6.62
HOXC13MA0907.1chr18:30054635-30054646GCTCGTAAAAA+6.62
JUNMA0488.1chr18:30053342-30053355TAAATGATGTCAT+6.67
JUNMA0488.1chr18:30055308-30055321TAAATGATGTCAT+6.67
JUND(var.2)MA0492.1chr18:30053341-30053356GTAAATGATGTCATC+6.82
JUND(var.2)MA0492.1chr18:30055307-30055322GTAAATGATGTCATC+6.82
Nkx3-2MA0122.3chr18:30052636-30052649ATTAAGTGTTTAA-6.19
ZNF263MA0528.1chr18:30053711-30053732GGGGGAGAGAGAGAGAGGGAG+6.13
ZNF263MA0528.1chr18:30055677-30055698GGGGGAGAGAGAGAGAGGGAG+6.13
ZNF263MA0528.1chr18:30053752-30053773GGAGGAGGAAAGAAAAAATGA+6.23
ZNF263MA0528.1chr18:30055718-30055739GGAGGAGGAAAGAAAAAATGA+6.23
ZNF263MA0528.1chr18:30053705-30053726GAGGGAGGGGGAGAGAGAGAG+7.06
ZNF263MA0528.1chr18:30055671-30055692GAGGGAGGGGGAGAGAGAGAG+7.06
ZNF384MA1125.1chr18:30053323-30053335TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr18:30053324-30053336TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr18:30053325-30053337TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr18:30055291-30055303TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF740MA0753.2chr18:30054304-30054317CCGCCCCCCCCCC+6.64
Enhancer Sequence
TTTTTTAATA GTTTATTTTT ATAATGAGAA GTCTCAAAGT TTGTCTTTAT TATAGAAAAC 60
TCATTGTTGA ATGGCTACCA CTTTACAATA AGGTTGTATG TATTAGTTAA TGTATTTACT 120
AACATAATAA ACAATACATT TATTACAGTA TTTATTCATC TTTGCTAATG TTGGTAAATG 180
GTAAAAAGTT GTTAATTGTT TATTCATGTT AACTCGCAAT GTATTAACTA ATGTTAACAA 240
GCATGACTGA TTTTATTAAT GCATTAGTAA ATGCTGTACA TAAATTATGC TGTACAGGTA 300
TTGTTCATAT TAGTTCATAT TTAAACCATT AACATTACTT ATAAAACTAC TGTATAATGT 360
AACTGTTGTA TGTATGTTGT TATATTATAT TTGTATGTAT TTTATATGTA TTTTATATTT 420
ATTTTGTTAT ATTTGTTAAC GTATGTGTTT TTGAAACATT TCATTAAGTG TTTAATGTAT 480
GTTCGTTATG CAGTATTATA AATAAATGTT ATAATGATTA AGTATTTTGT ACTTGATTTC 540
ATTATTGGAC ATATTTATAT TGAATACAAT TGTAAAGGCT AATATAATAT TTAAAAATGA 600
CATGTGGACC GACCGCGGGC CGCCAGCAGA CACTTATTTA AAACCAGCGG TCCGATGGCG 660
GACCACCGTC GGAAAAGCGG CGGGAGCCGA TGGTGGGCCG CTGGAATAAC GATGAGCAAA 720
TTGAGGTGGA CCGCGGGCGT CGCCCGCCAG TGGACCGCCG ACTTTGCCGC CGGCGGGCCG 780
CCAGTGGCCC GCTGGTCTTA TGTTAGCTGG GTAATACAAA TAAATAAAAG TAAATAGACA 840
AAAAAGACGT CAAAAATACT GTAAAAGGAC GTCAAAAAGA CGCCGAAAAG ACGTCGAAAA 900
AAGACGTTGA AAAGACGTCA ATAAAAGACG TCATAAAAAC TTTCATTCTG GCTCTTCAGA 960
GGACGTAATT TCAACGTCTG ACAGAGACGT AGAAAAGACG TCTTTTGGAC GTAACTTTGC 1020
TTGGTGGGAA GTTGTTGGGA GAAAGTTCAA GGTCCCAGAA TGCAATTCAA AAGCATAAAT 1080
AAACCGGGGT GGGGGGAGAA TTAATAAAAA CATGAATCAC AAAATACGGA AAACCGCATT 1140
TTTACGGAAT TTTTTTTTTT TTTCAGTGTA AATGATGTCA TCAAAAGAAT TAGTTATTCA 1200
TATAATGATA TTAACAGGCC CTCCGTCTGA CGCCCTGTAT GCTATTGATT TAAAAATGAA 1260
AACAAATAAA ATGTAGGACT TGAAAAGGCT CAATATTTTA TCCATCTATG TGCACTTGGT 1320
GAAGGCACAT CAGTAGACCG TGAAAAATGG CATTGAGCAT GCCAGTGAGT GAGGTTAAAC 1380
TACTGTACTG TTGGCTTGCA ATATGTGGGG GTACTTTTTG TAAATAAATG GTATGTAAGG 1440
GCTTCGGGTC CCCCAAAACT TTGTAAACCC GCGTGGGCTA TAGCTTGGGG AGCTTGTAGC 1500
ACTTGACAGT TTCAGTGCGT GCTGCTATTG AGAGGGAGGG GGAGAGAGAG AGAGGGAGAA 1560
GCCTCTCCAT CGCCCCCTGG AGGAGGAAAG AAAAAATGAC ACAGCTGGGC TTTCCCTTGC 1620
TGCTCTGAAT AGGACAGAAG TCCCAGAGAA AAGCGAATAG GAAGCAATGG AATTGAAAGT 1680
TTATAGATAG CAGCAAAGCT GGGAGCTGAA GAAGTGTATT AGCTGACAAA TGAAGGCGAA 1740
CCAAAAGCTT ACAGCACCTG GTATTCCCAG GCGGTCTCCC ATCCAAGTAC TAACCAGGCC 1800
CGACCCTGCT TAGCTTCCGA GATCGGACGA GATCGGGCGT GCTCAGGGTG GTATGGCCGT 1860
AAGCGAAGGT CGCAGTCAAA ATCTGGCTAT TTAAAAGGCA GCGGCGAGAG CAGAATAGCT 1920
CACACAGACA CAACACCGGG AGGAACAACC CTCCTTGTCC TCTCAAGTGT GTATCTGTCA 1980
GCCAGTATTT AAACTTACGA TGACAACATT TTACCGGAAG TAAAAGCGGC CGATGCTTGG 2040
AAAACTTTAA AGCAGACTTG TGCAGCACAC GACTTCTGTA CAGATGCTTA CCGGCCCCTT 2100
CATTAGAGAC ACCTTATTAG TTCAGAGTTG CCGCCCCCCC CCCGTTTTGC CCTCGCAACT 2160
GCATTATTTA TTTATTTATT TATTTATTCA TTAATTCAAT CATTTATTTA TTTAAATATT 2220
TAAATATTTA TTTATTTATT TATTTATTTA TTCATTTATT ATTTTTATGT TTGTGGCATG 2280
CACAACATAC CAACTTTTAT CCAAATATCT GGACTTAAAG CTCCAATGAA CGCTGGACAG 2340
AGAAACTCCG TGAACACAAA CAATCCGGAG ATGTGACTAA ACATGAACGT GAGTGCTGTT 2400
TTTCTCTACA ACAAATGTCA TGTTTGTCAT GTTACAGATT GCTAATTTTG CACACCTGAC 2460
CGCTCGTAAA AAGGGTCAGG GGCCAGAGTT TAATCATAAG CAATGAAAGT CCATCACCAT 2520
TTAACGAATT TGCAAAATAG TCTCGGGCCG CCGGCGATTT TTGTGTGTGA AATGAGCAAA 2580
GTTCTATTTT GATACTGGGT AAAAGGCATC ACAACATTTT TTGATGGCCT TTTAACAGAG 2640
TTTTTCGGCT TTTTAACGGA GCAACTGTGC AAAGTATGAA AAAAACAAAC AAACTGTCAA 2700
TTCACAATAT GTTGTGATTC ACAAGTGTTT CCCGTTAATT TATGGTTGTG AATTGCATCA 2760
CGGGACCCTG ATCTCTGCTC TGTCGACTTT TGATGTTTAA AATTCAACTC TGCAGTTTAA 2820
GGTAACCTAG ACGGTGTTGC AGTTTGGAAT ATTAGAACGT ATAGGGAGAA AAAAAAAGTA 2880
TGGAAAATAA CATGTGCTTG TTTTTGTAGC GTGTACAACG ACAACCCAGA CAATATATCA 2940
CTTTCAACTA ATAACCATGT CTATAAAAGT CACTTTTTCG TACTTTTCGA GGTTAGAAGT 3000
TGTTGGGAGA AAGTTCAAGG TCCCAGAATG CAATTCAAAA GCATAAATAA ACCGGGGTGG 3060
GGGGAGAATT AATAAAAACA TGAATCACAA AATACGGAAA ACCGCATTTT TACGGAATTT 3120
TTTTTTTTTC AGTGTAAATG ATGTCATCAA AAGAATTAGT TATTCATATA ATGATATTAA 3180
CAGGCCCTCC GTCTGACGCC CTGTATGCTA TTGATTTAAA AATGAAAACA AATAAAATGT 3240
AGGACTTGAA AAGGCTCAAT ATTTTATCCA TCTATGTGCA CTTGGTGAAG GCACATCAGT 3300
AGACCGTGAA AAATGGCATT GAGCATGCCA GTGAGTGAGG TTAAACTACT GTACTGTTGG 3360
CTTGCAATAT GTGGGGGTAC TTTTTGTAAA TAAATGGTAT GTAAGGGCTT CGGGTCCCCC 3420
AAAACTTTGT AAACCCGCGT GGGCTATAGC TTGGGGAGCT TGTAGCACTT GACAGTTCCA 3480
GTGCGTGCTG CTATTGAGAG GGAGGGGGAG AGAGAGAGAG GGAGAAGCCT CTCCATCGCC 3540
CCCTGGAGGA GGAAAGAAAA AATGACACAG CTGGGCTTTC CCTTGCTGCT CTGAATAGGA 3600
CAGAAGTCCC AGAGAAAAGC GAATAGGAAG CAATGGAATT GAAAGTTTAT AGATAGCAGC 3660
AAAGCTGGGA GCTGAAGAAG TGTATTAGCT GACAAATGAA GGAGAACCAA AAGCTTACAG 3720
CACCTGGTAT TCCCAGGCGG TCTCCCATCC AAGTACTAAC CAGGCCCGAC CCTGCTTAGC 3780
TTCCGAGATC GGACGAGATC GGGCGTGCTC AGGGTGGTAT GGCCGTAAGC GAAGGTCGCA 3840
GTCAAAATCT GGCTATTTAA AAGGCAGCGG CGAGAGCAGA ATAGCTCACA CAGACACAAC 3900
ACCGGGAGGA ACAACCCTCC TTGTCCTCTC AAGTGTGTAT CTGTCAGCCA GTATTTAAAC 3960
TTACGATGAC AACATTTTAC CGGAAGTAAA AGCGGCCGAT GCTTGGAAAA CTTTAAAGCA 4020
GACTTGTGCA GCACACGACT TCTGTACAGA TGCT 4054