EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-13026 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr18:30050617-30052059 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA10MA0899.1chr18:30050862-30050873TTTTTATTACT-6.14
RORCMA1151.1chr18:30051501-30051513TGACCTAGTTAC-6.22
Sox11MA0869.1chr18:30051391-30051406AAATATTTCAGTGTT+6
Enhancer Sequence
CTCAAAGCTG AATTTACAGC GTCAGTGCTC CAGTCCAAAA TGTAATATTG TATTCATAAT 60
TTGCTGCTGA TCAAGCAAGA TTTCTTATTT TTATCATGTT TTGTTATTTC AGGATTCATT 120
ATTGAATAGA AAGTTTAAAT TGAAAAGTAT TTGAATCAGA AATCTTAACT CTCTTCTGAT 180
CTGTTTTATG CACCCTTGTT TAATACAAGT ATCCATTTCT TAAAATGTGT TAGTAATATA 240
TATATTTTTT ATTACTTCTT TCTAGATTTT GGATCGTCCT CTACTCACTC TACCACTTTG 300
TTTTTCCTTG CCAGACTTCA TTCAAGGTAA GTAATATTAT AGTGTCACTT AAAAGTGTTC 360
CCAATGATTA CTTTTATTAA TGTTAATATT AATATCAACT GCATCAAACA AATAGCCTAT 420
TAGAATGATT TCTGAAGGAT CATCTGACAC TAAAGTAATG ATGCTAACAA ATCAGCTTTG 480
ACCTCACATT AATAAAATAT ATGGTCACAT TTATTTTGAT GGTCTGTTTG TTGAATTTAA 540
GCTGCATTGC ATCTACATGC CATCTAATTC TCATTAGATT ATAAGTAGAC TGTTAGGGTT 600
GCGGTTAGGG TTGGTGTAAG TTGACATGTA CTTGGTAAAT TAAGGGTTAG GGTTAGGGTT 660
AGTTAATGTC TGTTGAAGGA GCAGAATCAA CAGATATTAA GCAGACAGTC TATTAATACT 720
CAAATGGACC ATTTACAATG TATTGAAATT AAAAATCATT ATATTAAACT GTAAAAATAT 780
TTCAGTGTTA CTTTTAAACT GTAAATTAAT GTTATCGATC AAATCAATGC AGTCTTGATG 840
TCCAATAAAA AGACAATAAA AAATACAAAC ATTAATGTCC ATAATGACCT AGTTACTGAT 900
GATGGACAAA AATAATGACT GATGATTCTG TTATTTCAGG ATAAGAAAGA AGCCTGCTAC 960
AAGAGAGACA GCGGAAGGGA GCCTCAAAGA CATTTTTATT AGGATCTGCT AATCATGAGG 1020
GGGCAGACAA AAGAACCTGC ATTTTCCTTC AGCTTAATAT CAGGGGTCGC CACAGCGTAA 1080
GGAACTGGAT ATTACTTTGG CATATGTTTT ACATAGCCTT CCAGCTGCAA CCCAGCACTG 1140
TGAAACACCC ATACACTCTC GTATTCACAG ACACTTCTAC ACTATGTTCA AATTCACCTA 1200
TAGCACAAGT GTTTGGACTG TGGTGGAAAC CCACACCAAA ACAGGGAGAA CATGCAAACT 1260
CCACACAGAA ATGCCAGCGG ACCCAGCCGG GACTCATACC AGCGACCTTT TTGCTGTGAG 1320
GTGACAGTCT GAGCCACTGT GCTGCCCCAG TGTAGTTATT AATAACCTCC AGATGTTTTA 1380
CAGTTTGATT TTGTAATAAT AATGCACGTT TAGATTTATT GTAATATGTT AATATTTATT 1440
CG 1442