EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-12934 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr18:25158773-25159671 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MAFFMA0495.3chr18:25159045-25159060ATGCTGCCTCAGCAT+6.51
MAFFMA0495.3chr18:25159045-25159060ATGCTGCCTCAGCAT-6.69
MAFGMA0659.1chr18:25159042-25159063ACTATGCTGCCTCAGCATATA+6.77
MAFGMA0659.1chr18:25159042-25159063ACTATGCTGCCTCAGCATATA-7.17
MAFKMA0496.2chr18:25159043-25159062CTATGCTGCCTCAGCATAT+6.04
MAFKMA0496.2chr18:25159043-25159062CTATGCTGCCTCAGCATAT-6.36
NR2C2MA0504.1chr18:25158996-25159011TGACCTCTGACCTAC-6.6
Nr2f6MA0677.1chr18:25158996-25159010TGACCTCTGACCTA-6.55
RXRBMA0855.1chr18:25158996-25159010TGACCTCTGACCTA-6
RXRGMA0856.1chr18:25158996-25159010TGACCTCTGACCTA-6.18
RxraMA0512.2chr18:25158996-25159010TGACCTCTGACCTA-6.03
Enhancer Sequence
AGTAATATAA TATGTAATAA TATATATATA GTACTATGTA TTAAATATAT AGTATAACAC 60
CATATATAGC CCCAATTACA AGTATTACAT CAATTACATT ACTTTAATAC ACGATTGATT 120
AATAGTTGCC AGGTACAAAG CCAAAAAAGT TTGTTAGATA TAGTCCAAAA CACAGAGATA 180
GAGCTGCTAC AGCGATATGT TCAGGCAGTG TTGCAGAAAA GGGTGACCTC TGACCTACTG 240
TTGCTCCTAA AGGTGTCCAC TAACACACCA CTATGCTGCC TCAGCATATA CATGATGCAT 300
CTTCATGTGT GCATCAGCTA CAGCAAGAAG AGGGGGCTAA TAGTGACCTA ATAGCTTAAA 360
TCTGTGCATT TTCTGATGAA AAGCAGTTGG CACGGCGGGC AAATTTGTGG GAGGCTTTAC 420
AGTAAGGAAG CAGGAAAAGC CAAGCTCCCC CTGTGGGAGT TGTTTTTTTC ATAGGACTGT 480
CGGTATGCAT GTGCTGCCGG GCCAGTTCAG ACCTACCTCA TGGCTGGCTG GTTGGCATTC 540
CAGCCTCATT CTTTAATTAC GTCTCCACTC CTACACAGAT CAACCAGAAG ACCGCTCTAA 600
AAGCACTTGT GTCAGTCATC TGATGGTCTT ATTTAAGTAG ACTGCAGACA CATGTAAAGC 660
ACAGGGCATA AAGTAAAACA CAGTATGCAT AGCTTACTGA CCTCTGCCAT TTAGAATGGA 720
TGACTGTACT TTAAAATTAC TGCTACAGTG AAAACATGCA TTCCAAAATT ATAGCAGTCA 780
TATACAAGAA ATGTTCACAA GTTTCTTATT CATTATCAGA CAACAAATGT ATGGATAGCA 840
TGGCTCTTGT TGCATTTTTA TTTTATTTTC ATCGAATCAA TTTGATTTAA CTTTAACG 898